Conférence One Health : Microbiote, plantes et biodiversité

5e conférence dans le cadre du cycle de conférences One Health & Santé Globale. Année universitaire 2023/2024.

Intervenants :
Pr. Robert Benamouzig (UP13)
Dr. Joël Doré (INRAe)

Je suis très heureux de nouveau puisque tout à l’heure nous avions un agronome et et un prof de de médecine qui se trouvait sur la table et on se retrouve en fait devant la même la même situation et et je vais donner la parole s’il le veut bien au prophè professeur Joël doré

Et ensuite nous écouterons le professeur benamousig sur un sujet aussi important que le microbiote plante et biodiversité je vous rappelle peut-être en introduction que toutes ces conférences sont enregistré et donc elles sont vues et d’ailleurs amplement vu sur le comment dire sur sur le canal de l’université l’vsq et d’ailleurs don certaines sont

Supérieures à 5000 vues donc ce qui montre bien comment nous débordons non seulement la faculté mais nous impliquons aussi les citoyens ce qui était un des objectifs de ces rencontres qui sont des rencontres qui allient un certain nombre de professionnels travaillant sur le même territoire mais

Selon des mé différentes et et selon des historiques de leur formation totalement différents vous avez la parole mon cher ami merci beaucoup merci merci donc je vais présenter le volet 1 de cette séquence qui sera suivi par la présentation de Robert benamousig et j’ai sous-titré ma présentation nourrir

La symbiose humain microbe je suis agronome comme on l’a dit et chercheur à inraé depuis mon début de carrière et j’ai travaillé sur le Microbot intestinal depuis 40 ans maintenant alors je vais commencer par une petite déclaration de lien d’intérêt comme je fais d’habitude quand je m’adresse à des à des

Médecins j’ai à in Rae qui est un institut de recherche appliqué beaucoup de travaux qui ont été financé par des collaborations avec des partenaires industriels de l’agroalimentaire et de la pharmacie en général et puis je suis également comme c’est indiqué en bas ici cofondateur et conseil scientifique pour

Des petites start-up mat Pharma qui a été créé en 200 14 nouveau BIUM GMT qui ont été créés pendant la covid il y a quelques années et j’ai cooordonné ce ce livre Le Microbot intestinal avec Philippe marteau en 2017 alors je vais inscrire ma présentation dans le concept général de

De one health et insister beaucoup sur le le fait que la biodiversité est un élément crucial dans dans ce domainelà et pour le oneehalth bien sûr ce à quoi j’ai été exposé personnellement c’est essentiellement la partie santé humaine et dans ce contexte là l’importance de la richesse des des microbiomes humains

Mais en fait qui reflète la richesse des microbiomes au niveau de la planète et je commence par ça ça concerne la 6e extinction qu’on est en train de vivre aujourd’hui avec une citation que j’ai tenté de traduire de Elisabeth kolbert qui dit nous décidons sans que ce soit nécessairement intentionnel des chemins

D’évolution qui resteront ouverts et de ceux qui seront à jamais fermés aucune autre créature n’y était parvenue jusque là et ce sera malheureusement notre héritage le plus durable et ça concerne la 6e extinction celle des insectes des oiseaux des mammifères des poissons ah excusez-moi je ne suis pas en plein

Écran et il faudrait que je gère cette question là et donc je parle ici de la 6e extinction de ce qu’on peut voir en fait y compris des mammifères qui disparaissent quotidiennement et ce sur quoi je veux vous emmener tout de suite c’est que il existe une autre 6e

Extinction invisible celle qui concerne la perte de la richesse de nos Microb ot et on a quelques travaux qui sont illustrés ici qui ont comparé les microbiotes de population dans des pays occidentaux à ceux de populations qui sont restés à l’écart de la modernité en fait c’est des des chasseurs cueilleurs

En Tanzanie par exemple ou des tribus en Amazonie et quand on fait ces comparaisons on se rend compte que le le critère principal en fait qui saute aux yeux c’est cette perte de à peu près 50 % de la richesse des microbiomes dominants des des populations ça nous

Concerne nous avons perdu 50 % de nos microbiomes euh à travers des changements de vie dont on va parler euh et puis malgré ça hein on est euh 50000 milliards de bactéries qui sont présentes au niveau de la peau et au niveau des des interfaces mucosales de

L’organisme euh c’est la sphère orale et respiratoire la sphère eurogénitale et bien sûr la sphère digestive qui a été mon objet de recherche pendant tout ce temps euh et qui contient la plus grande richesse et diversité de de microorganismes pour ceux qui interagissent avec le corps humain et au

Plan génétique en face des 23000 gènes du microbiome humain du génome humain il y a en moyenne 600000 gènes microbiens et leur fonction et donc une contribution assez importante qu’on peut attendre à au fonctionnement de l’organisme et le Microbot va agir comme un régulateur c’est un régulateur endocrinométabolique il va potentialiser

Des ingrédients alimentaires notamment à travers la dégradation des fibres et leur transformation en petites molécules qui sont essentielles à nos cellules en micronutriment il va produire des vitamines il va bioconvertir des selles bilères et également des toxifiants de l’alimentation il va jouer un rôle direct antimicrobien j’aime bien dire

Que chaque fois qu’on mange un morceau de fromage c’est 100 milliards de de microbes qu’on ingère des bactéries des levures des champignons pas tous sympathique et aucun de ces micro-organismes ne va s’implanter dans les intestins grâce à cet effet de d’exclusion compétitive qu’exerce nos microbes normaux il va jouer un rôle de régulateur

Immuno-inflammatoire en fait il va promouvoir l’homéostasie de de des défenses naturelles du système immunitaire c’est-à-dire son aptitude à réagir à monter une réaction inflammatoire quand il est nécessaire de gérer de laamération mais aussi à gérer la tolérance et le côté plutôt immunorégulateur et puis c’est un régulateur neurovégétatif au sens où il

Produit et il envoie à travers tout le corps de façon systémique des signaux qui vont qui vont être le la la base de ce qu’on appelle aujourd’hui les les axes l’axe intestin foie intestin poumon intestin cœur ou intestin cerveau alors je vais organiser ma présentation en trois parties je vais commencer par le

Microbot intestinal et comment on l’a étudié mais j’irai assez vite parce que je pense que la méthodologie est pas le cœur de ce que ce qu’on doit discuter je vous parlerai de microbiome et de symbiose et j’essaierai d’illustrer pourquoi je parle de symbiose et puis enfin j’irai sur le terrain de comment

On peut faire quand les choses se dérèglent pour remettre les choses d’aplon et ça vous concerne forcément mais ça concerne par par extension la prévention aussi alors on s’est rendu compte euh à la fin du siècle dernier euh que quand on comparait ce qu’on est capable de faire

Pousser au laboratoire sur un milieu de culture et ce qu’on voit au microscope sur la même suspension de contenu intestinaux humains il y avait une différence énorme qu’on a appelé en anglosaxon le Great plate count anomalie ou l’anomalie de dénombrement euh qui faisait qui nous disait en fait que on

Pouvait cultiver au laboratoire au mieux 30 % en gros de ce qui était présent dans nos écosystèmes et donc on a été amené sur cette base-là à réévaluer complètement à travers des outils indépendants de la culture le Microbot intestinal dans son intégralité et ça a été essentiellement basé sur l’accès à

L’information génétique et pendant très longtemps ces travaux se sont appuyé sur l’utilisation d’une technologie qui séquençait un gène un gène unique et assez unique dans ses caractéristiques un sémentide un marqueur de l’évolution en fait qui est le gène qui code pour l’ADN de la petite sous unités du

Ribosome donc le ribosome c’est depuis l’invention de la biosynthèse des protéines par euh par les ribosomes donc ça remonte à quelques milliards d’années sur la terre et donc c’est une structure qui a été conservée à travers l’évolution et sa séquence interne permet de retracer l’évolution et de repositionner un organisme contemporain

Dans l’arbre généalogique du vivant et puis au tournant du siècle à peu près on est passé sur la l’aptitude à séquencer l’intégralité de l’information génétique qu’on pouvait extraire à partir d’échantillons int humain par exemple des celles parce que c’est effectivement ce sur qui on travaille beaucoup et reconstruir

Euh la vision génétique de l’écosystème à la fois qui est là et qui fait quoi finalement ou quel est le potentiel fonctionnel du système euh ça ça date à peu près de 2021 et c’est vraiment un tournant assez révolutionnaire dans nos nos aptitudes à caractériser l’écosystème et du coup sur cette base-

Là j’ai trois diapos seulement sur ce que ça nous a appris mais ça nous a vraiment ça a renforcé l’image qu’on pouvait avoir de la la biodiversité du microbiot intestinal humain ces courbesl elles représentent l’augmentation de la prise en compte ou de la reconnaissance de la diversité du système donc c’est en

Nombre de de gènes non redondants à en fonction du nombre d’individus caractérisés notre première publication 2010 on avait caractérisé à peu près 150 individus et on avait identifié 3,3 millions de gènes microbiens différents et puis on a continué on a arrive à 1267 individus européens chinois américains

En 2014 et on est à 100 millions de gèes et notre base de référence aujourd’hui elle fait plus de 100 millions de gènes et on on l’utilise tous les jours en fait alors ce sont les rares les gènes rares qui continue à augmenter et on voit bien que on n’ pas atteint le

Plateau encore on a des collègues belges qui s’amusent à faire des calculs et qui nous disent en Belgique dans la zone flamande il faudrait 40000 individus pour commencer à voir cetteou courbe atteindre un plateau on fait le calcul en France et les calculs nous disent oui

Faut plutôt viser 100000 en fait donc la la la vision de la la de la référence mondiale et est en cours de construction j’en parlerai un petit peu et puis on a enfin on s’est dit on va pouvoir caractériser l’individu moyen en terme de microbiote et donc on a cherché quels

Étaient les microbes qui étaient très conservés entre individus on se fiche un petit peu des noms de d’espèces ici d’ailleurs quelque fois il y a seulement un code parce que les ESP n’a pas de représentant cultivé dans nos collections de souches actuelles mais on a pu reconnaître la petite vingtaine

D’espèces bactériennes qui sont très conservés plus de 95 % des individus caractérisés alors que dans chaque individu on va observer à peu près 300 espèces dominantes dans le le méthagénome ce qu’on appelle le méthagénome donc une petite fraction conservée énormément de diversité et de variabilité interindividuelle et quand

On l’étudie au fil du temps on se rend compte qu’il y a une remarquable stabilité pour un individu donné en dehors de changement alimentaires majeur ou de traitement ou de chirurgie bien sûr et puis on a eu deux surprises dans ces travaux là donc la première que j’illustre ici c’est la reconnaissance

Que il y a pas un individu moyen en terme d’organisation écologique de l’écosystème intestinal au contraire dans les premières publications on avait identifié trois trois types écologiques qu’on avait appelé entérotype et tout récemment on a des collègues qui continuent à travailler là-dessus et qui nous disent si si on pousse un petit peu

Le nombre d’individus caractérisés ici une étude basée sur 35000 échantillons intestinaux humains bien on voit apparaître une complexité encore plus grande on a C états globaux du système et 24 états locaux c’estàdire dans chacune des branches que l’on voit se dessiner on a des sous-parties des sous-sections et on peut même relier

Certaines partie de cette organisation écologique des systèmes intestinaux à du risque ou a de la santé et puis la deuxième surprise qu’on a eu c’est quand on a essayé de représenter la distribution de la population en nombre d’individu en fonction du nombre de gènes observés dans le l’échantillon

Caractérisé et donc on voit que le nombre de gènes s’étale entre moins de 200000 et plus d’un million de gènes ou à peu près un million de gènes et on voit qu’on a un épaulement donc c’est pas du tout la courbe en chapeau classique de la biologie humaine c’est

Une courbe en chapeau où il y a des individus avec un Microb de pauvre et des individus avec un microbiote riche c’est la courb en bleu ici les courbons orange c’est les antérotypes les trois premiers qu’on avait décrit que j’ai caractérisé dans la diapo précédente et en fait ce que montre cette illustration

C’est que dans l’entérotype ici bactéïes dominé par le genre bactéroïdes on a en fait une population avec le genre bactérioïise dominant et à microbiot pauvre et une population avec le genre bactérioïise dominant et un microbiote riche et on a pu depuis 2013 depuis cette première description montrer queil

Y a un lien très fort entre la richesse du microbiote et le risque ou la santé et puis on a aussi des travaux qui sont intéressés au facteur de variation du microbiote intestinal alors on sait que il y a énormément de facteurs et des facteurs exogènes qui vont pouvoir

L’impacter le stress ou l’anxiété bien sûr le recours au médicaments notamment les antibiotiques le recours à des alimentations ultra transformé ou qui apporte des chimies inhabituelles et puis la pollution par également la chimie inhabituel et on a des collègues qui ont sur des études de plusieurs milliers d’individus euh pu classer les

Différents paramètres en fonction de leur leur impact donc ils sont du plus impactant ou moins impactant dans cette illustration qui ne reprend qu’une petite partie l’ensemble qui est présenté ici explique à peu près 16 % 16 % seulement on devrait dire de la variabilité interindividuelle des microbiomes le premier c’est les

Traitements les médicaments on sait que un antibiotique même s’il est pris pour gérer un problème de de la sphère orale ouou pharingé va avoir un impact sur le Microbot intestinal donc on n’est pas étonné par ça viennent ensuite les paramètres de l’analyse biologique ou des symptômes intestinaux sur lesquels

On va pas pouvoir jouer beaucoup directement puis enfin l’alimentation et les paramètres de l’alimentation les habitudes alimentaire sur lesquels on va pouvoir jouer on va en reparler l’état de santé global l’anthropométrie on va pas changer ça non plus et enfin les habitudes de vie l’activité la degré de sédentarité ou l’activité physique par

Exemple vont pouvoir avoir un impact et donc ces travaux-là nous disent si on prend en compte seulement les paramètres alimentaires les composés d’origine végétale notamment les fibres alimentaires et les polyphénols vont être parmi les plus impactants sur ce paramètre de richesse du Microbot intestinal qu’on avait évoqué juste

Avant et puis dans les changements en fait dans nos pratiques on a aussi le recours de plus en plus fréquent à des grandes coortes euh pour des études qui s’intéressent au microbiome donc là c’est quelques Cortes au niveau mondial qui s intéresse au microbiome pour des populations qui sont au-delà de 800

Individus j’ai rajouté le French gut dont Robert vous parlera tout à l’heure vous voyez qu’ en a quand même pas mal en fait et beaucoup au niveau européen un petit peu États-Unis ou Amérique en général Amérique avec un S et puis bah très peu finalement dans la partie de

L’hémisphère sud ou de la zone intertropicale une petite conclusion sur cette première partie on est humain on est microbien on est écosystème sauf pour quelques espèces bactérienne qu’on a identifié aujourd’hui les microbiomes diffèrent beaucoup entre individus il diffèrent sur l’aspect structurelle composition et fonction alors que sur l’aspect

Fonctionnel malgré tout on est quand même globalement assez similaire on a des microbes différents qui vont contribuer à des fonctions assez similaires on peut penser par exemple à la dégradation des fibres ou à la métabolisation des acides miliaires par exemple et puis les médicaments la nutrition les habitudes de vie vont

Impacter le microbiote et se faisant la relation qu’on a avec nos microbes que j’appelle ici symbiose et je vais maintenant aller un petit peu plus loin sur ce cette notion alors on on est on est euh d’un environnement virtuellement stérile on pourra en débattre si vous

Voulez euh et et ce qui se passe dans les premiers moments de la vie et assez unique puisque au moment de la naissance on va rencontrer le monde microbien pour la première fois avec ce ce niveau d’un intensité en tout cas et on va développer notre microbiote en même

Temps que mature et s’autonomise notre système immunitaire le microbiote va contribuer à ces fonctions qui sont citées ici un petit peu différemment de ce que j’ai fait tout à l’heure mais on peut passer rapidement ça va de la digestion des fibres jusqu’à la signalisation vers tous les organes à

Travers la paroie intestinale en fait cette monocouche de cellule humaines qui sépare le contenu de l’intestin et la voie sanguine ou systémique et puis ce que l’on on sait c’est que c’est ça conduit à cette symbiose où le microbiote donc des microbes avec lesquels on interagit est

Reconnu comme une composante du soie par le système immunitaire et la maintenance de cette reconnaissance est essentielle au maintien de la santé et du bien-être ce système complexe bah il peut dériver il peut s’altérer au plan écologique c’est la perte de la fonction de barrière la la prévention contre la

Colonisation par des microbes de l’environnement et donc le risque d’infection donc vous connaissez notamment comment la prise d’antibiotique à l’hôpital peut s’accompagner de l’installation d’un clostrome difficilé dans l’intestin B c’est typiquement cette perte de fonction qui est en cause et si c’est au niveau de la balance ou de la

L’homéostasie immunitaire ça peut s’accompagner d’un risque accru de maladie immune ou auto-immune alors on a comme image en terme d’épidémiologie cette description qui a été faite par Jean-François bac en 2002 qui nous dit la médecine avait fait des progrès incroyable en en terme de contrôle des maladies infectieuses c’est

Ce qui est présenté à gauche avec la la diminution des des courbes d’incidence de maladies infectieus et dans le même temps ce qui était observé sur la même période 2è moitié du siècle dernier c’est cette augmentation d’incidence des maladies chroniques concernant présenter ici la maladie de chrô le diabète de

Type 1 ou la Sclérose En plaag pour de l’autoimmunité l’asthme les allergies en général et puis on a quelques exemples assez frappants comme cette qui montre l’augmentation d’incidence de l’autisme aux États-Unis c’est une augmentation exponentielle une naissance sur 50 aujourd’hui aux États-Unis et à la naissance où sera dans la vie concerné

Par l’autisme et c’est incontrôlé et donc malgré ces progrès là on est dans cette situation aujourd’hui et ça perdure et c’est vrai aussi pour le le diabète et l’obésité qui ont été mentionné par les présentateurs précédents c’est vrai pour les maladies hépathiques au S sens large et c’est

Vrai pour certains cancers et pour des maladies neurologiques donc neurodégénératives ou neuropsychiatriqu et en fait on peut se demander légitimement comment on a fait pour en arriver là et c’est une question très difficile à laquelle on ne sait pas vraiment répondre aujourd’hui mais on sait qu’on a changé énormément de choses

On a changé tout ce qui entour la naissance le mode de naissance l’environnement de naissance il y a des villes sur terre aujourd’hui où 80 % voire 90 % des naissances se font par césariennes bah ça interdit le transfert de Microbot de la mer vers le le nouveauné que qu’on évoquait un petit

Peu avant et et ça entraîne une colonisation complètement différente on a changé nos mode de vie notamment la composante alimentaire et fibre alimentaire on était à plus de 50 g de fibbr par jour euh au milieu du siècle dernier et avant et aujourd’hui on est à

171 en fait par jour en France en moyenne et puis on a changé l’exposition à des composés exénobiotiques de l’environnement soit de l’aliment soit de la la chimie environnementale les l’espérance de vie aux États-Unis diminue depuis 2019 en partie probablement à cause de l’incidence des maladies chroniques alors les changement de mode

D’encadrement de la naissance c’est entre autres les antibiotique dans la période précoce de la vie et on a un travail qui a porté sur des dizaines de milliers de enfin plus de 10000 individus des groupes d’individus et qui étudie le risque relatif de développer différentes infections chroniques

Affection chronique euh et qui euh qui montre que le risque est effectivement significativement sur surélevé pour l’ASME pour les les rénites allergiques et cetera chaque fois que c’est jaune en fait hein ici euh quand on a dans les cinq première années de vie une exposition multiple à des traitements antibiotiques alors on

Savait on savait ça un petit peu ça confirme et ça renforce un petit peu le message puisque là on a un grand nombre de de risques de maladies chroniques qui sont indiqués et puis on a on a changé l’alimentation alors on a changé et pour

Cause à gauche ici on a le le déclin de l’utilisation de variété végétal donc c’est peut-être mon côté agronome qui me conduit à vous présenter ça mais on a diminué par je crois que c’est à peu près un facteur 80 le le nombre de variétés qui sont utilisé pour les

Différents fruits et légumes principaux en fait de nos alimentations euh donc ça c’est une perte de diversité majeure et c’est c’est une perte de diversité de la chimie que voi arriver nos nos microbes intestinaux et puis si on s’intéresse à à l’augmentation de des conditions chroniques en lien avec des changements

Alimentaires bah pour tous ces changements alimentaire on a une contribution au à la mortalité précoce en fait augmenté en lien avec le le régime alimentaire et on se rend compte assez vite en regardant un petit peu dans le détail que tout ce que j’ai entouré en rouge ici c’est une réduction

De l’apport de fibre alimentaire en quantité et ou en diversité qui a un marque ur très très fort de cette augmentation de de risque voilà alors on sait de donné comme objectif de documenter l’altération du microbiot dans des maladies chroniques et donc on a travaillé sur un grand nombre de

Contextes j’ai même mis ici l’immunothérapie du cancer et dans ces contextes là on a pu documenter que on a effectivement quand on compare des patients et des sujets sains une altération du microbiot intestinal qu’on avait appelé disbiose et dans une période assez récente en fait on s’est

Rendu compte que c’était un petit peu plus compliqué que ça comme toujours en fait ce à quoi on a à faire c’est une rupture de la relation de la symbiose entre l’humain et ses microbes en plus de l’altération du microbiote on a de façon assez systématique dans ces contextesl un syndrome

D’hyperperméabilité intestinale une inflammation et un stress oxydant qui vient assez naturellement avec l’inflammation avec les les cellules de l’immunité et donc on a potentiellement un un système complexe qui s terre et pas juste le Microbot intestinal même si ça a été mon objet de recherche pendant 40 ans je suis bien obligé de

Reconnaître que en fait c’est la relation qui qui s’altère alors dans ces comparaisons patient sujet sain cas contrôle on n pas de causalité on a aucun élément pour dire que Ben le Microb saltère et la maladie apparaît ou le contraire donc on a quelques outils qu’on a mis en œuvre pour essayer dans

Quelques cas de documenter un lien de causalité et en fait c’est basé sur du transfert de microbiote donc on transfère du microbiote de l’humain vers la souris de patient ou de contrôle sain vers des animaux et on montre dans l’obésité par exemple sur une étude qui

A porté sur des des jumeaux c’est ridora 2013 euh discordant pour l’obésité que quand on transfère le Microb du jumeau obèse ben les souris vont prendre du poids beaucoup plus vite que quand on transfère le Microb du jumeau non obèse puis ça a été appliqué dans plusieurs

Contextes qui sont cités ici dans les maladies inflammatoires dans la maladie de crône par exemple dans la nche dans la cirrose dans l’obésité c’était le premier en fait en 2000 4 je crois euh et puis aujourd’hui dans la sclérose en plaque dans la dépression dans dans l’autisme et puis a au-delà de ce

Transfert de l’humain vers l’animal vers le modèle euh du transfert de Microbot de l’humain vers l’humain donc ça fait suite à l’observation de l’impact du transfert de Microbot comme un moyen de gérer le l’infection à clostrome difficilé et je reviendrai à la fin de ma présentation mais ça a été testé dans

Un grand nombre un nombre de contexte de maladiie chronique assez différent un peu moins élevé que le nombre que je citais auparavant mais le principe est de voir si en reconstruisant une symbiose fonctionnelle normale on arrive à au moins diminuer les symptômes d’une maladie c’est ce qui est observé par

Exemple dans la rectocolite hémorragique pas à tous les coups ça dépend beaucoup de la façon dont est pratiqué le transfert de microbiote c’est vrai dans la cirrose où des collègues indiens arrivent à maintenir en vie alors que on est sur des stades très très avancés de patients qui normalement en France

Seraient transplantés immédiatement en vie pendant un an des patients après du transfert de microbè fécal il y a un travail qui a montré que on peut sortir les patients du diabète par transfert de microbate fécal pendant 6 semaines avec une dérive au fil du temps et ça a été

Appliqué dans l’autisme et on pourra en parler si vous avez des questions là-dessus et donc ça nous ça nous positionne dans une situation où on peut voir cette relation cette symbiose comme vraiment au cœur de l’altération et donc on a communément une perte de richesse un syndrome de l’intestin perméable qui

S’installe une inflammation euh en conséquence de ces deux éléments et puis du stress oxydant qui va aggraver encore plus euh la perte de richesse du Microbot intestinal donc on voit bien comment on peut aboutir à des des causalités circulaires une sores de cercle vicieux ou des dominaux qui

Peuvent s’entraîner les un et les autres en fait et les théoriciens des systèmes complexes nous disent quand on a ça on a plus de continuum entre les États alors pour nous les états ça va être la santé la la maladie pas de continuum entre la santé et la maladie ça veut dire des

Ruptures complètes et et je vais expliquer un petit peu ou schématiser un petit peu comment ça peut fonctionner pour nous ce que ça veut dire quand on renseigne nos nos partenaires et nos collègues c’est que on a au moins quatre leviers c’est probablement plus complexe

Que ça pour être réaliste mais on a au moins quatre leviers qu’on peut utiliser pour le diagnostic pour la prédiction qu’on peut utiliser potentiellement pour l’intervention donc pour la prévention et et la thérapie alors reprend dans la diapo suivante quelques données de des théoriciens de des systèmes complexes en

Fait René Tom un mathématicien français qui en 1983 publiait déjà sur les paraboles et les catastrophes et sur cette ce mécanisme qu’on appelle l’yérésis quand le système bascule dans un état d’équilibre alternatif et Martin schffer en Hollande qui nous dit B ce mécanisme là d’altération il est vrai en

Biologie ce qu’il appelle in nature mais il est aussi vrai en société dans les crises économiques par exemple c’est absolument les mêmes mécanismes qui fonctionnent d’installation de cercle vicieux qui va faire basculer le système d’un état d’équilibre à un autre alors on va se positionner en haut à gauche

Puis on stresse le système on prend un antibiotique il va être altéré je vous ai dit il est résilient en fait si on enlève l’antibiotique il va revenir mais par contre si on pousse le système au-delà de sa robustesse on va basculer on va enclencher le cercle vicieux basculer dans un état d’équilibre

Alternatif état d’équilibre parce que si on enlève le facteur de stress ben on va potentiellement rester là rester là pendant longtemps et dans certains cas on pourra pas revenir à l’état initial sauf à faire par exemple du transfert de microbiote donc le retour à l’état initial peut être très compliqué et bon

C’est ce que j’illustre un peu en bas avec la bille dans les bassins d’attraction comme les appellent les théoriciens et et c’est ce ce passage d’un état d’équilibre à un autre qui peut entraîner le basculement de la santé vers l’prèsmaladie voire vers la maladie et ce que je vous raconte là

C’est pas encore complètement pris en compte aujourd’hui dans la pratique médicale ou dans la pratique thérapeutique alors ça va concerner surtout les grands levier de la symbiose que sont l’inflammation ou du moins l’immunité et le microbiote et donc on va avoir la possibilité de documenter assez facilement en même temps une

Altération du microbiote donc du contenu intestinal et une altération au niveau du compartiment systémique des paramètres de l’immunité et donc on a testé ça dans le cas d’un projet européen que que je coordonne à travers l’utilisation d’un modèle animal euh et de l’induction d’inflammation avec le DSS le sodium

D’xtrant de sulfate le DSS induit de l’inflammation au niveau distal dans l’intestin il est dans l’eau de boisson et on peut le dosé et donc on a testé ce qui se passe entre 0 et 3 % de DSS dans l’eau de boisson avec des cours d’induction de 3 jours espacé de 2

Semaines et on regarde ce qui se passe 40 jours après l’arrêt des traitements et donc on l’ on laisse au le au temps au système le temps de de se réinstaller et donc on va voir si on est résilient ou si on a une altération durable 40

Jours après quand on a 2 ou 3 % de DSS c’est ce qui est présenté en bas ici on a 85 % des animaux qui sont installés dans une situation où soit la paroie intestinale est de façon mesurable altéré soit le microbiote est de façon mesurable altéré soit les

Deux dans quelques pourcents on a une résilience et par contre en dessous de 1 % de DSS dans l’eau de boisson on a majoritairement des animaux qui sont résilients qui sont capables de revenir à l’état initial donc quelques mots sur cette partie deuxième partie nos tissus nos organes interagissent avec nos

Microbes et avec des fonctions qui sont en gros des bénéfices mutuels typiques d’une symbiose une altération de la symbiose va s’accompagner d’une perte de fonction essentiellement protectrice et euh on peut avoir des états stables alternatifs euh maintenus par l’installation d’un cercle vicieux caractéristique de de la symbiose

Altérée donc c’est vrai dans plein de contextes potentiellement dans un grand nombre de maladies chroniques auxquelles vous aurez affaire dans votre carrière et ma trisème partie a vocation à nous emmener sur le terrain de soat en fait qu’est-ce qu’on va pouvoir faire à

Partir de là et euh bah le le soat il va je vais le décliner en trois parties euh est-ce qu’on peut faire du monitoring d’altération de symbiose est-ce qu’on peut restaurer donc faire de la prévention ou est-ce qu’on peut carrément faire un reset complet et sur la première partie monitoring en fait on

Est dans cette situation où il est tout à fait possible pour le médecin de prescrire en plus de l’analyse biologique classique à gauche gauche l’analyse du microbut fécal aujourd’hui je suis pas en train de parler de passer par des société de servicees qui s’installe à droite à gauche et qui

Propose ça à monsieur tout le monde comme un moyen de répondre à une curiosité je suis en train de parler de du domaine médical en fait et donc ce que je conçois ce que j’imagine et ce que je propose c’est que dans les années qui viennent un laboratoire de biologie

Médicale sera à même de prendre comme prescription l’analyse du microbiote fécal de l’individu qui est face au médecin il faudra probablement pendant quelques années un peu de soutien en terme de Data science parce que c’est c’est pas tout à fait classique en fait comme analyse de données mais par contre

Ça pourra servir servir à inté la partie altération de la symbiose dans le diagnostic dans le monitoring au long cours intégrer l’état de la symbiose en réponse à des recommandations nutritionnelles ou à une prise en charge clinique classique alors pour que ça fonctionne il faut cocher plusieurs cases et les

Premières l’ont été c’est il faut des standards en fait j’ai évoqué au début le fait qu’on avait travaillé beaucoup à partir d’une méthode gène unique cette cette méthode là on démontre aujourd’hui qu’elle est non standardisée et probablement non standardisable par contre l’approche métagénomique génô complet de tous les

Microbes dominants celle-ci on a publié en 2017 qu’elle est standardisable et donc on a cet outil à disposition pour servir un besoin médical et puis il faudra mettre en évidence qu’il y a un bénéfice clinique donc il faudra aller plus loin il faudra des essais clinique pour le démontrer il faudra un chemin

Réglementaire pour que ça serve effectivement des applications la mise en place d’application de test diagnosti nouveau et puis il faudra aussi l’éducation des patients et des des professionnels du monde médical alors ah oui une petite phrase de Elisabeth han que j’aime bien positionner ici en fait on peut concevoir une clinique du

Microbiome et une une médecine et des cliniciens du microbiome pour pour l’avenir en une diapositive où on en est ben je l’évoqua on a effectivement publié en 2017 les standard nécessaire pour processer les échantillons pour déterminer leur configuration au niveau métagénomique et on a en terme de grand

Nombre des projets qui se lancent aujourd’hui et notamment plusieurs projets qui s’inscrivent dans le million microbiomes from humans project le projet de 1 million de microbiomees humains qui a été lancé en 2019 et notamment le projet le Microbot français le French g dont vous parlera Robert bedam music après ma présentation

Alors comment on peut fonder des espoirs dans ce domainelà bah notamment parce qu’on a déjà dans les données scientifiques apporter l’évidence de bénéfice clinique potentiel potentiel et notamment je reprends la courbe que je vous ai montré tout à l’heure qui est la courbe de distribution de la population

Humaine en fonction du nombre de gènes dans le microbiome intestinal dominant la richesse estalent de moins de 200000 à à presque 1 million et on retrouve cette courbe avec lespaulement en fait en fait cette courbe quand on sépare dans la population qui est représentée ici de 300 individus les obèses et les

Non obèses en orange et en vert on voit qu’elle est franchement bimodale ça veut dire qu’on a y compris chez les individus non obèses une population à Microbot pauvre et ce qu’on a montré à travers les travaux qui sont listés là et bien d’autres c’est que être du côté

Que j’appelle ici posibiose microbiote appauvri ou atrophié en en gène et en espèce ben c’est une situation favorable en terme de santé et ou en terme de risque donc c’est associé à une situation de métabolisme et d’inflammation de paramètres inflammatoire altéré dans le surpois et l’obésité c’est associé à une

Non réponse à une contrainte nutritionnelle à en gros une restriction calorique dans l’obésité seulement les patients ne vont pas perdre de poids quand ils ont un Microbot pauvre mais ils vont pas améliorer leur lipid sanguin ils vont pas améliorer leurs paramètres de diabète quand ils en ont ils vont pas améliorer leur inflammation

Qui est souvent sous-jacente et même si elle est de bagrade elle est là mesurable euh c’est associé à une plus grande sévérité et à une progression plus rapide dans le contexte des maladies hépatiques et puis dans le cancer en fait on a de plus en plus d’évidences qui émergent c’est associé à

Une survie sans progression réduite après une une immunothérapie dans le mélanome ou dans le cancer du du poumon au point qu’on peut prédire en fait en analysant le Microbot d’un patient s’il va répondre ou pas à à l’immunothérapie et c’est associé à une survie réduite après une transplantation de une greffe

De moelle dans le cancer du sang euh ou un risque plus élevé de complications de type maladie du greffon contre l’ôte dans après la greffe de moile dans le cancer du sang on est dans ce contexte là où on a quelques espoirs à fonder sur la photographie du microbiote comme un

Outil à prendre en compte dans le la pratique médicale alors qu’est-ce qu’on a pu faire pour euh essayer de documenter comment on pourrait utiliser cette connaissance nouvelle des microbiotes dans la restauration donc dans la prévention en fait on avait on a fait un travail on n’est pas dans le

Domaine médical même si on est en terme d’essès clinique qualité Pharma on a fait un travail avec breeder une société qui fait du pain et on leur a dit on peut faire un pain multifibre très enrichi en fait un pain qui contient 11,5 g de fibre par 100 g donc avec une

Prise de 150 g par jour euh l’individu moyen va prendre en plus de sa prise alimentaire habituelle 16 g de fibre donc on va doubler la consommation de fibre chez les chez les humains et on a fait cet essai randomisé contrôlé en double aveugle avec un crossover parce

Que le pain fibre ne n’était pas distingable à l’œil du pain contrôle et donc on avait un nombre assez modeste de volontaires une vingtaine de volontaires au départ alors avec un tour de taille au-dessus de la médiane nationale quiit le critère principal en fait qu’on avait choisi de risque de de

Ométabolisme il passe sur le pain FIB puis le pain contrôle ou l’inverse et on peut analyser toutes les données à la sortie on n pas d’effet significatif sur la richesse du microbiote en elle-même probablement 20 individus c’est pas suffisant en fait pour ça mais par contre on modifie la composition du

Microbiote et notamment on va doperer des microbes qui sont connus pour être capable de dégrader les fibres alimentaires et se faisant produire des composés qui sont protecteurs et puis on va surtout avoir un effet sur le métabolisme on va améliorer le profil lipidique on contrôle mieux le cholestérol total et le LDL cholestérol

Et on a une augmentation de 20 % de la sensibilité à l’insuline des observations que nos collègues du centre de recherche en nutrition humaine renalp avait jamais fait auparavant et donc qui sont assez assez intéressants en fait alors il y a des variations interindividuelles je mets ici une

Référence qui nous dit que même pour des jumes jumeau les vrais jumeaux si on leur propose un un repas test la réponse glycémique ne va pas être la même donc potentiellement le microbiote va nous jouer des tours et la variabilité interindividuelle fait que il faut pas aller trop vite en terme de

Généralisation par rapport à ces observations un autre domaine sur lequel on a travaillé c’est ce qu’on appelle les biothérapeuties vivant on travaille sur les microbes intestinaux on les caractérise et on arrive parfois à identifier des potentialité vraiment intéressante au plan fonctionnel donc je peux parler de fcali bactterium prosnit

C’est un travail qu’on a fait en France en fait avec des collègues médecin de la PHP de l’incerme on a montré que certaines souches sont anti-inflammatoires sur des modèles animaux et anti-inflammatoire avec potentiellement la contribution d’une protéine qui a été identifiée donc dans certains cas on a identifié le microbe

Impactant le métabolite qui peut expliquer ou récapituler à peu près 100 % de l’impact qu’on a observé et puis les équipes ont assez souvent accompagné la création de start-up qui ont comme objectif de cultiver en masse le microbe en question l’encapsuler et l’apporter vivant ou pas vivant à des patients pour

Voir si effectivement on arrive à moduler les symptômes dans la maladie aujourd’hui on a un essai en cours avec fcal bactterum prosn dans la maladie de chrô piloté par Harry soocol et la société excellium AK signifie là un cas particulier c’est une bactérie qui a été décrite pour son aptitude à dégradé le

Mucus produit au niveau de la paroie intestinale en 2012 donc c’est très récent et on a pu montrer que cette bactérie là elle est intéressante sur des modèles animaux de diabète et Patrice Cany et williem Devos ont contribué à créer la société amancia qui l’a produit en masse et dans un essai de

Phase 2 a montré que la bactérie a effectivement un impact sur les paramètres du diabète mais c’est un impact qu’elle a quand quand elle est vivante ou quand elle est pasteurisée était conçu plutôt comme leur contrôle négatif bah en fait ça marche aussi bien

Alors c’est un un cas où on a un peu un revirement d’un d’un développement industriel qui était plutôt perçu comme un développement pharmaceutique et qui devient un développement de complément alimentaire parce que le chemin vers la mise sur le marché est beaucoup plus court pour un supplément alimentaire ou

Un complément alimentaire que pour un un médicament euh voilà on pourra répondre à des questions s’il y en a sur ces ce domaine-là et puis je voulais illustrer comment on peut utiliser la l’idée de du cercle vicieux que j’aiévoqué tout à l’heure en prévention et c’est des

Choses qu’on a testé en fait avec des collègues en utilisant le modèle souris qui est utilisé pour développer les antidépresseurs donc c’est des souris qui sont stressé pendant 4 semaines et sur lesquelles on peut mesurer l’altération comportementale par des mesures de l’anxiété et du comportement dépressif on les met pendant 3 semaines

Sous traitement à avec un antidépresseur dans notre cas la clomypramine et puis on corrige complètement les altérations comportementales quand on fait ça par ce qu’on a fait c’est qu’on a utilisé trois actifs alimentaires la glutamine qui va effectivement jouer très fort sur la perméabilité intestinale c’est une source d’énergie majeure de la paroie

Intestinale on a utilisé la curcumine qui est un polyphénol qui va jouer comme antioxydant anti-inflammatoire donc plutôt sur l’autre partie du du des leviers du cercle vicieux et puis laactobacillus ramnosus GG un probiotique assez bien connu très documenté depuis un grand nombre d’années et dont on sait qu’il peut

Avoir des effet sur la stabilité du Microbot intestinal il est recommandé par l’organisation mondiale de gastro-enterologie en association à une prise antibiotique par exemple fait partie des deux micro-organismes qui sont recommandés pour ça mais il va aussi jouer sur la perméabilité intestinale sur l’inflammation grâce à une catalas sur le stress oxydant et

Dans ce contexte particulier de la dépression c’est une bactérie qui produit du du GABA donc il va aussi pouvoir moduler la concentration intracérébrale de de sérotonine et ce qu’on a pu montrer dans ce travail c’est que B quand on perturbe nos animaux on altère le comportement ça c’est une

Mesure du temps passé dans la zone centrale d’un d’un open field ça s’appelle donc c’est une mesure d’anxiété ben on génère des animaux anxieux et quand on met nos composés individuellement parfois on corrige pas toujours quand on met les trois ensemble on fait aussi bien qu’un antidépresseur donc c’est des ingrédients alimentaires

Dont l’effet combiné va être synergique et aussi efficace qu’un qu’un antidépresseur tricyclique paranéral c’est vrai pour les paramètres d’anxiété de dépression comme c’est montré ici voilà j’arrive à la fin de ma présentation ou presque je voulais présenter ça ici je sais que vous avez parlé tout à l’heure de régime

Méditerranéen et du j’avais anticipé en fait et ce que montre ce travail c’est une métaanalyse là encore sur des milliers d’individus qui montrent que le régime méditerranéen peut réduire l’incidence de maladie chronique et de cancer et que globalement l’alimentation peut réduire de à peu près 20 % la mortalité précoce toute cause confondue

Et c’est significatif dans toutes les indications qui sont listé ici voilà et puis pour aller sur ma dernière partie bah comment on peut faire pour faire un reset complet donc j’ai un peu tisé là-dessus je vais vous parler de transfert de microbat fécal et je pique une diapositive à rissocol qui montre

Que bah l’objectif du transfert de microbate fécale ou de microbiothérapie écosystème complet est de déplacer un écosystème disbiotique et de remplacer par un écosystème en nebiose autrement dit euh de reconstruire une symbiose haute microbe fonctionnelle et j’ai qu’un exemple à donner que j’utilise à partir de données de la petite société

Matfarma donc je vai parler qui est une société française basée à Lyon qui conditionne du contenu intestinal humain pour la microbiothérapie en accompagnement du traitement du cancer et donc le le premier travail qui avait été fait par matharma chez l’humain avait consisté à chez 25 patients diagnostiquer le sémimyoloïde aigu très

Rapidement récupérer un échantillon de contenu intestinal une selle en réalité la conditionner avec un process de conditionnement assez particulier malgré tout pour préserver au maximum les les micro-organismes et puis les réadministrer en autologue donc donc le donneur le reciiveur et son propre donneur après la chimiothérapie d’induction et les traitements

Antibiotiques qui suivent ce que montre les les chronas ça s’appelle les les graphiques en bas c’est la richesse et la diversité du microbiote avant avant la chimiothérapie d’induction et après après dans cet exemple particulier ici n =1 on a anentérococus comme genre microbien totalement dominant il représente 90 %

Du microbiote intestinal donc on a presque une oculture en fait on a deux administrations par voie basse par voie anale à 24 he d’écart et on reconstruit intégralement le Microbot intestinal pratiquement à l’image de ce qu’il était au départ on a mesuré en fait et on mesure queon reconstruit 9 100 % du

Microbot intestinal du du patient lui-même quand on mesure l’altération du microbiote bah on altère beaucoup évidemment avec la chimiothérapie d’induction et puis on reconstruit on reconstruit partiellement euh 90 % en terme de richesse en gène ou en espèce le microbate intestinal si on s’intéresse particulièrement au microbes

Producteur de de buttirate qui est un petite molécule produite par la fermentation anaérobie et qui est une source d’énergie pour notre paroie intestinale c’est également un régulateur contre le la carcinogénèse on reconstruit intégralement ces populations là et puis aussi si on s’intéresse à un paramètre comme la néoptérine qui est un marqueur

D’inflammation on a un burst inflammatoire après la chimio d’induction et le traitement antibiotique qu’on résout complètement donc on reconstruit complètement le l’homéostasie immunitaire par ce procédé làà voilà j’aiécouté la radio ce matin et ce matin le Réseau Action Climat et la société française de nutrition ont publié un rapport intitulé comment

Concilier nutrition et climat du coup je me suis dit je vais rajouter quelques diapots quand même leur leur claim en fait c’est que le P NNS le programme national de nutrition santé devrait aller un petit peu plus loin et s’intéresser à promouvoir une transition vers des régimes alimentaires durable durable en terme d’impact

Climatique et il propose qu’une réduction de 50 % de la consommation moyenne actuelle de viande en France sans exiger aucune complémentation en fait pourrait répondre au moins partiellement mais grandement à cet objectif et donc pour étailler un petit peu ça j’avais envie de glisser quelques chiffres dans dans vos cerveaux euh

L’alimentation contribue pour à peu près 20 % on va dire ou l’agriculture à peu près 20 % aux émissions de gaz à effet de serre en France en 2022 ça a pas dû changer beaucoup et ce qui est présenté à droite c’est la distribution en en biomasse mammifère sur la planète donc

Sur la planète les tonnes ou les kilos d’humain c’est à peu près 34 % de la biomasse de la planète le sauvage c’est 4 % et l’élevage c’est 62 % des animaux sur la planète euh et puis bon j’ai ouais j’ai pas besoin de sdessigner ça davantage et puis si on s’intéresse

Maintenant à la contribution composé alimentaire par composé alimentaire à l’émission de gaz à effet de serre bah ils sont ici rangé du plus impactant ou moins impactant on voit que bah le plus c’est la viande bovine alors la viande bovine d’élevage viande viennent ensuite le mouton les fromages qui aussi ont leur contribution

Parce que il y a l’élevage derrière les vaches laitières c’est plutôt ce qu’on mange le plus souvent quand on mange de la viande rouge en réalité en France et puis pas très loin le porc et le poulet mais enfin quand même beaucoup moins impactant et et ça nous dit que la

Contribution au gaz à effet de serre de la composante d’origine animale est majeur dans nos habitudes alimentaires aujourd’hui par comparaison tout ce qui vient des plantes et vraiment a r des prèes par rapport voilà et encore quelques chiffres pour finir je me fais plaisir 77 % dans le monde de la surface

Agricole est utilisé pour bah faire pousser des plantes qui vont servir à élever des animaux c’est 85 % en France alors que bah les protéines animales nous apportent 18 % des calories contre 82 % par le végétal et alors que bah les protéines animales nous apportent 37 %

De nos protéines contre 63 % du végétal et en France le l’émission moyenne de de gaz à effet de serre devrait être non elle est par individu de 9 tonnes d’équivalent CO2 par individu en moyenne aujourd’hui en fait vous pouvez le calculer facilement sur les sites de laad euh

Et si on voulait atteindre les accords de Paris euh bah il faudrait réduire ça à 2 tonnes par individu par par an quand on mange de la viande tous les jours on est déjà à 2,2 tonnes en fait de CO2 quand on mange du bœuf une fois par semaine on

Est à 1,2 tonnes simplement par cette composante là l’alimentation et le végétarien sans produit laitiers il est à 0,5 tonnes de de CO2 équivalent par an voilà je vais terminer par ça message de de vos microbes les la science des microbiomes a documenter ce que on peut considérer comme une

Nouvelle frontière en fait l’humain microbien donc quand vous serez assis en face de quelqu’un pensez que il est il est microbien les microbiotes sont personnels individuels d’une certaine façon assez stablebl au cours du temps temps et donc ils sont sources de biomarqueur et le microbate peut fournir ses signatures de risque de maladie

D’aggravation de risque d’aggravation ou de réponse à des traitements une faible richesse en gène et en espèces est un paramètre récurrent un biomarqueur récurrent de l’altération de la symbiose entre l’homme et ses microbes et on sait que les expositions environnementales au médicaments à la chimie alimentaire ou

De la pollution ou les modes de vie peuvent altérer la symbiose entre l’aut et ses microbes et alors la nutrition mais dans la nutrition notamment les composés sur la base végétale en fait et les microbes vivants aussi peuvent être des bioactifs stratégiques pour la prévention et puis donc les systèmes

Alimentaires peuvent à la fois contribuer à améliorer la santé humaine mais également la santé planétaire voilà je vous remercie de votre [Applaudissements] attention et je vais passer la parole à mon collègue Robert menaming merci par qu’on va passer d’uneune partie passionnante au plan scientifique à une partie plus on va dire essayer de

De faire progresser encore le nos connaissances et si possible à terme notre action tu m BL voilà je crois qu’on part bien là c’est biennous on essaie d’avoir voilà c’est super merci beaucoup donc bon là je pense que que vous êtes convaincu maintenant de de l’importance du microbiote vous deviez l’être avant mais

Là c’est c’est très construit et vous avez une vision théorique complète et je je je le dis sans flagornerie aucune mais mon ami Joë doré fait probablement un des meilleurs topos sur le microbiot parce que j’en écouté pas mal qui est absolument complet simple simplifié et en même temps c’est

Ça que j’apprécie beaucoup philosophique on va redescendre un tout petit peu des choses concrètes donc nous on on s’est on s’est interrogé il y a maintenant je sais pas parce que je vois jamais le temps passer pour moi c’est toujours il y a hier il y a demain et il y a

Aujourd’hui aujourd’hui donc aujourd’hui on est ensemble jeen suis très heureux je vous remercie de l’invitation mais hier donc mais probablement hier il y a déjà 4 5 ans 6 ans hein euh l’idée était de de de voir ce qu’on pouvait faire pour aller un peu plus loin dans cette

Logique et donc on a effectivement essayer de de de de faire avancer les choses via cette étude qui a un nom français le Franch gut alors ce frangech gut c’était l’idée d’approfondir les connaissances déjà euh de réunir dans des groupes des experts de cultures différentes et de surtout

Faire appel à la population générale pour nous aider et c’est ces trois tréspieds importants qui ont été la racine intellectuelle de cette construction en cours alors elle se situe évidemment dans le cadre parfait qui vient d’être défini c’est-à-dire que on commence à avoir quand même de très bonnes connaissances sur cette mécanique

Qui voudrait que la dysbiose via les les facteurs d’altération soit en lien avec l’apparition ou l’aggravation de certaines pathologies al ça c’est c’est pour l’instant une vraie question parce que on a beaucoup d’éléments qui laissent penser qui font penser qui nous laisse certainement avec un goût de

Relative certitude mais on est au pays de Descartes et rationnellement on manque encore de preuve la preuve parfaite donc c’est en en cartésien qu’on est parti dans ce projet et l’idée était derrière que si on améliorait cette connaissance on devait arriver à prévenir par la prédiction voire à

Soigner si on arrivait à trouver des des clés importantes et donc on s’appuie sur une connaissance de les on va dire les 20 dernières années mais mais surtout les 10 dernières années de connaissance scientifique extrêmement solide et dans un cadre assez compétitif aussi puisque on commence à voir des connaissances

Dans pas mal d’endroits et dans pas mal d’équipes et c’est à ce niveau-là qu’on a voulu se situer c’est-à-dire Joë l’a pas dit parce qu’il a été un peu modeste mais c’est l’équipe qui a sorti effectivement ce métagénome et donc l’idée c’était de rester en tête de

Peloton si possible pas à la queue et avec cette ambition là je sais pas si on la maintiendra mais voilà on voulait quelque chose de très ambitieux et donc quand on a commencé à réfléchir sérieusement on s’est dit que en fait à l’époque il y avait quasi

Pas d’étude à plus de 3000 que quand on avait des choses c’était souvent des quelques témoins quelques quelques sujets qui onent des symptômes ou une maladie on avait pas d’approche systématique et donc on on s’est dit que la première chose à faire c’était déjà d’avoir une photo avec beaucoup de

Pixels vous savez que les les les les télés les appareils photo pas toujours le pixel comme comme référence mais plus on a de points mais mieux c’est donc on s’est dit on veut beaucoup de pixels et deuxièmement on veut des pixels de qualité et puis on veut aussi définir le

Lien et là on a une chance assez assez importante c’est qu’en même temps qu’on avait l’accessibilité de la méthodologie l’accessibilité technique mais aussi l’accessibilité économique c’est les coûts par les machines les automate baissé on a pu s’appuyer sur une évolution du système de renseignement de la santé en France qui est imparfaite

Mais qui est quand même extrêmement intéressante qu’elle couvre tous les Français qui est un système de des données de remboursement on va y revenir tout à l’heure et c’est ce cet axe là qui nous a fait démarrer l’étude alors aujourd’hui par exemple c’est une une diapo don on s’est servi ce matin avec

Joë dans dans le lancement d’un projet deun programme de recherche effectivement on est on estime aujourd’hui qu’on peut avoir un un un métagénome de pour l’ordre d’environ une production d’autour de 100 € en espérant que ça baisse encore et en même temps on a des logiciels enfin je vais pas

Rentrer dans le détail surtout que c’est pas du tout mon champ d’expertise c’est celui de mon voisin et et d’autres on a des euh pipeline d’analyse avec des des biomathématiciens des logiciel des créations d’algorithmes qui évoluent en permanence qui sont au meilleur niveau c’est c’est C ce mélange là qui a rendu

Les choses possibles et donc euh voilà comment comment tout ça a été créé c’est la petite histoire de de de l’affaire c’est ce consortium alors le consortium il est privé aussi en partie c’estàd que ça c’est une une particularité c’est qu’on a essayé de drager quelques gros industriels ou des petits pour s’appuyer

Nous apporter leur problématiqu ce qu’on pensait vouloir aussi être en interaction avec la société y compris sans a priori que la firme c’est le le diable et que le privé ça doit être quelque chose d’absolument pas fréquentable par des médecins et des grands scientifiques voilà alors on est dans un

Contexte qui parallèlement à nous a évolué parce que vous voyez en 2021 c’est les toutes petites mais déjà 2024 nous on se situe avec nos 100000 mais voyez en Finlande plus de 7000 l’Estonie 200 les les Belges de500 les Israéliens sont sont un projet à 10000 et tout ça va

S’intégrer dans dans dans cette dynamique mondiale dont on a parler avec le le million espéré alors donc notre projet comment il s’articule bah il a d’abord fallu monter toute l’équipe aller chercher un minimum de sous et démarrer une phase pilote où on a testé les premiers outils

Et là ça a été le 2022 c’est la rentrée 2022 exactement et à ce moment-là bah à la même table à peu près avec pas plus de personnes dans la salle même plutôt moins on lance le projet et on explique que le portail va être ouvert et j’avais

Fait un Paris avec l’équipe j’avais dit ça va être vachement bien si on arrive avoir les 3000 en 2 ans ça serait super et à la fin du weekend on est à 4500 donc là on n’était pas préparé du tout du tout du tout du tout du tout du

Tout et donc il fallait envoyer les kit les machin autant vous dire qu’on a ramé un peu mais ça c’est fait voilà et donc je vais vous raconter des choses alors l’idée donc c’est cette photo cartographiée et puis le lien via le système du snds avec des hypothèses

Cette fois-ci où on pourrait imaginer que des personnes peut-être déjà atteintes mais qui ne le savent pas ou pas atteintte vraiment on va leur laisser un certain nombre d’années d’évolution et notre cette étude elle est faite avec un un un recul des datas de 10 ans donc on peut savoir les

Expositions 10 ans avant au moment où on travaille mais aussi avec une vision prospective sur 20 ans c’estd que quand on rentre on peut sortir aussi sec qu’on est rentré mais nous on va les suivre électroniquement pendant 20 ans et donc on va savoir s’il développe des maladies

Parce que si on on est capable de voir qu’ils ont été remboursés pour ça pour ça et pour ça c’est très probablement qu’ils ont développé cette maladie là il on a des algorithmes aussi de snds qui vont nous permettre de prédire voilà donc l’idée quelque part

Ça sera de de de de de peut-être ou d’avoir des nutritions préventives des thérapeutiesés préventives des des des des prédictions c’est en tout cas une des promesses qu’on peut imaginer pas forcément intenue mais qu’on peut imaginer comme pas complètement délirante alors l’idée aussi c’était de de s’appuyer sur la participation des

Citoyens qui voulaient bien nous aider et donc de sensibiliser le grand public ça pouvait pas faire de mal puisqu’on a déjà des données intéressantes et des actions à faire indépendamment de l’étude donc ça ça et en en même temps s’il pouvait nous aider à partir par leur participation ça pouvait que faire

Du bien avec des populations on verra notre pyramide des âges tout à l’heure mais aussi se dire d’emblé que tiens ça serait bien aussi de s’intéresser au plus jeunes par exemple mais pas qu’au plus jeune voilà alors bien sûr cette expertise de l’unité inraméagénopolis euh avec tout tout le

Travail qui avait été engendré je pense que Joë vous a tellement bien expliqué la chose que je peux passer vite puis nous en soutien parce qu’on sait ce que c’est qu’une étude épidémio parce qu’on sait la clinique et parce qu’on peut assurer un aspect réglementaire solide et c’est cette ces chosesl alors l’idée

C’était que toute personne majeure et là maintenant on est en train de travailler pour que les mineurs puissent rejoindre puissent participer alors les comment ça se passe en pratique et là aussi c’est une une nouveauté même en recherche clinique on a on n’est pas les tout premiers mais on

Est dans les dans les tout premiers avoir développé une recherche purement électronique habituellement recherche clinique vous savez pour ceux qui qui ont déjà fréquenté bah c’est un médecin qui a recruté qui a sensibilisé il a vérifié les critères machins il a vu en consultation on va proposer on va donner

Pendant la consultation on va revoir et ainsi de suite là tout est électronique tout est à la maison et c’est une une une science de la recherche clinique qui est moderne parce qu’elle était pas possible non plus il y a 10 ans on nétait pas familier de l’Internet à ce

Point-là les questionnaires pouvaient pas être développés avec les outils aussi facilement qu’aujourd’hui complet c’était pas sécurisable dans le parce que vous savez qu’on se fait voler ces ses données le dans les mutuels aujourd’hui donc il fallait on s’est appuyé nous sur une expertise extrêmement solide de de de de données

Pour pouvoir être à l’abri de de j’espère de à jamais de ce genre de problème et on vérifie en permanence les les évolutions et voilà donc on va sur Internet on va taper le frch gut on est immédiatement accueilli avec en plus une bonne communication c’est des petits

Pictogrammes un peu rigolo sympa c’est pas du carré médical habituel et on va s’identifier on va s’informer on va être apte à donner son consentement en ligne c’est un des premiers consentements en ligne massif qui a été développé on répond en moins de 10 minutes au questionnaire et on fait bien attention

Aussi à se restreindre de toutes les questions passionnantes qu’on voulait tous se poser pour faire un truc court quit à faire après d’autres pour ce voilà pour pouvoir rentrer facilement et après on on ressollicite les gens pour des plus longs et après bah tout un système de Amazon like où le truc arrive

À à à la maison euh à la maison je sais pas si je me demande si j’en ai pas jeouis en amener un je sais pas si je l’ai pris oui voilà donc on reçoit un kit qui moi je moi j’ai développé le dans une vie antérieure un peu de le dépistage du

Cancer colorectal en France donc c’est le même mais il est bien plus fun voilà et et et et donc voilà on on on on a ça et les gens renvoient le leur tube et le tube revient à l’hôpital pour des raisons d’anonymisation parce que souvent ils ont mis leur nom leur prénom

Leur adresse tout ça donc ça c’est pas question euh donc l’équipe médicale en milieu médical va tout anonymiser avant que ce soit tout pseudonymisé de façon à ce qu’on puisse plus jamais euh il CIR c’est dire facilement que c’est Monsieur Dupont tout en pouvant aller revoir

Monsieur Dupont ça toute la beauté de du circuit électronique voilà et donc on peut contribuer et je vous engage à contribuer si vous avez aujourd’hui plus de 18 ans et les deux seules paramètres importants c’est qu’on peut pas contribuer tout de suite si on a pris des antibiotiques là à l’instant ou si

On a une coloscopie à l’instant pour des raison de préparation colique si euh voilà là il faut attendre 3 mois mais sinon ça s’arrête là on peut euh et si on est d’accord on peut y aller donc on va remplir euh des volets démographiques des volets santé des volets alimentation

Je vous ai mis un peu comme ça parce que c’est on est quand même en milieu médical donc que vous voyez un peu donc c’est des choses hyper basiques l’âge la taille le poids le mode de naissance la naissance prématurée et des choses de mode de vie le temps écran l’activité

Physique le tabac le temps de résidence en France c’est important aussi par rapport à à à l’origine et et au au microbiotes d’importation d’autres pays le lieu de vie urbain rural en sachant que comme on a le code postal on peut aussi reconstruire et puis euh pour pouvoir contrôler demander les maladies

Des gens s’ils sont en al ou pas et ainsi de suite euh les habitudes alimentaires de base c’est que 21 question avec des portions de légumes de fruits de légumineus de fruits secs de produits séraliers raffinés alors ça se présente pas comme ça ce sont des des questions pragmatiques mais c’est avec

Des fréquences et euh ça c’est le premier étage on a un FFQ traditionnel qui est proposé aujourd’hui il est réalisé par 80 % des volontaires qui lui est complet on va dire plus traditionnel et puis il y a ce système donc du système national des données de santé qui va associer les données

Hospitalières donc toutes les hospitalisations les données de remboursement des médicaments et malheureusement au bout d’un certain temps pour certaines personnes les cause médicale de décès et là on a des variables à l’infini des algorithmes et on est en train dans d’embarquer des des parce que c’est aussi très neuf des

Spécialistes de cette nouvelle science qui est en train de se créer pour nous rejoindre et en sachant qu’on a aussi une expertise interne alors là là sur les données de séquençage donc on vient d’en parler longuement je je vais pas en parler aussi longtemps et puis tout ça à

L’échelon minimal c’est les séquences plus la l’âge le sex et l’IMC ainsi que le pays d’origine sont versés dans ce projet mondial du du million don don on vous a on vient de vous parler avec Joel dor alors des des premières datas là pour pour pas faire le teasing trop

Longtemps voyez à peu près euh la population de l’étude euh par rapport à la population française la population de l’étude c’est les barre plus étroite plus large chez la population française et on voit que euh on n’est pas si mal sur les là ça doit être sur les donc à

Peu près les les les la première tranche des des des volontaires on a refait l’analyse et on reste pas si mal et on on voit par contre qu’on est clairement sous représenté à ce stade chez les patients les plus âgés et chez les plus jeunes et donc on essaie de corriger par

La communication du réseutage pour arriver à à l’équilibre euh quand on regarde la la la la la répartition géographique aussi finalement entre ce qu’on observe dans dans les dans le recrutement et ce qu’on observe en population française il y a une petite légère surreprésentation des des grandes métropoles on va dire île-de-fance

Au ver ronalp mais finalement on n’est pas si loin des de la population dans sa rpartition française et là aussi on pourra corriger et et et redresser soit mathématiquement soit en faisant des actions de communication le le on a quelques sujets qui sont déjà dans d’autres études et ça ça sera une des

Forces on va en parler de croiser potentiellement d’autres études soit qui n’existe pas encore soit qui existe déjà avec ces données voilà alors évidemment moi je suis gastro-entérologue donc je vais vous parler un petit peu j’ai fait moi aussi je aussi je fais ma slide plaisir don donc ben d’emblé alors qu’on

Les recherchait pas on on a une bonne représentation de certaines maladies donc bien sûr les troubles fonctionnels mais aussi les maladies inflammatoires et le reflux puis d’autres et là on se dit bah voilà c’est simple c’est quand on aura 100000 on aura des effectifs d’emblé suffisants pour aller voir ce

Qui se passe dans ces maladies c’est pas mal et puis en fait quand on regarde les autres maladies parce qu’on n’est pas sectaire on voit que ça sera vrai pour beaucoup de maladies maladies métaboliques des maladies respiratoire des troubles psychiatriques des maladies neurologiques le cancer donc on devrait

Déjà imaginer que on pourra avoir la puissance pour des maladies suffisamment fréquentes et d’emblé on voit qu’on a environ 25 % des sujets qui qui se présente comme avec une pathologie et environ 70 % qui se présentent sans pathologie comment ça marche alors je sais pas si vous

Serez intéressé ou pas mais on peut rentrer là-dedans à tout moment c’estàdire que pour ceux qui sont jeunes et qui font les études c’est un concept pour ceux qui sont jeunes encore mais un peu moins jeunes on peut rejoindre la dynamique facilement c’estàdire que c’est une étude qui est architecture

Ouverte il y a un comité de pilotage on se rapproche du comité de pilotage on explique qu’on est intéressé par cet aspect-là des choses et on voit comment on peut euh pluger euh les deux études c’est pas si simple que ça évidemment parce qu’il y a des problèmes

Réglementaires les problèmes de sous il y des problèmes de politique il des problèmes de de timing mais c’est c’est fait pour et on a déjà maintenant engrangé enfin et démarré euh trois euh essais comme qu’on appelle encilaire et on a probablement au moins déjà une trentaine dans euh je vais dire en

Perspective et j’espère qu’il y en aura des centaines à terme voilà donc ça c’est aussi une chose importante de ce de ce montage là vous voyez là-haut tous les partenaires donc la p et linra l’in sererme la GR Grou paritch bien sûr très important pasteur très impliqués le Gô

Génoscope et puis les partenaires privés qui interviennent parfois très activement pour nous aider voilà ça c’est le petit groupe parce que je pense qu’il faudrait qu’on rajoute au moins une vingtaine de personnes qu’on a oublié mais c’est juste pour dire que pour arriver à ça il faut quand même plus

Que une ou deux ou trois personnes faut vraiment une énergie commune avec chacun sa spécialité et enfin et dernièrement pour pour conclure si vous savez pas quoi faire ce weekend s’il pleut ou s’il fait beau vous pouvez toujours aller traîner sur le site vous inscrire et si vous trouvez

Que la participation est pas trop compliquée je vous on sait jamais à ce momentlà vous pouvez faire participer tous les copains et tous les copines ça fait participer et je vous ai vu je dis ça parce que par que la salle est quand même très jeune on manque de très jeune

Donc n’hésitez pas à faire des dons ils sont anonymes et pseudonymes donc je vous promet que je je pourrais pas venir savoir qui qui a eu la générosité de venir mais mais j’en seraai très heureux et et et et pareil parlez-en autour de vous ça se veut participatif on a

Aujourd’hui au moment où je vous parle 9000 premier don FO en banque on a 14000 personnes qui sont dans le circuit donc il y a il de de qui ont rempli les questionnaires et qui sont dans le circuit pour nous envoyer les selles mais il en manque encore donc si on

Calcule bien 90000 et quelques donc il faut y aller n’hésitez pas je pense qu’on on sera content Joë tout à fait merci [Applaudissements] beaucoup merci beaucoup pour ces deux présentations je me permettrai de poser une question justement par rapport à cet appel tel qu’il est fait là et qui

S’inscrit tout à fait et j’encourage d’ailleurs tout le monde mais des travaux on Éth ont été faits là-dessus ne serait-ce que sur le fait de cliquer simplement et d’avoir une information qui est importante et quelquefois de ne pas savoir ce qui se passe derrière c’est-à-dir à qui appartiennent les données comment elles

Vont être exploitées jusqu’à éventuel des systèmes comme 20 CNB 20 cent qui ont comment dire qui ont travaillé justement et qui ont été amenés à faire un certain nombre de de collectes allant à des nombres de millions justement de c’était pour des test au début génétique en particulier la question qui se pose

C’est donc l’information tu répondu on ne peut mieux he par rapport à la question ma deuxième question serait le rapport avec l’Assurance Maladie c’est-à-dire il serait bon éventuellement ou avec le fameux sniram là de manière à voir comment en tant que chercheur on a la possibilité de rentrer dans ces données qui sont

Particulièrement choisi et protégé c’est je crois je crois que ça ça mériterait beaucoup de voir un tout petit peu et ma troisième remarque sont des remarques euh c’est qu’est-ce qui est donner en quelque sorte à tous les participants c’est-à-dire en terme d’information comme la plupart je suppose que l’anonymat est totalement

Préservé comme cet anonymat est préservé on ne peut pas bien entendu leur entraîner à moins que ce soit peut-être euh comment dire avec des formules statistiques qui permettent de remonter éventuellement l’identité des personnes de manière à à donner des conseils qui seraient individualisés ensuite aux personnes surtout quand on est dans des

Grandes périodes imaginons que on diagnostique plus ou moins ou qu’il y ait une une une proportion de risque important de développer telle ou telle sorte de cancer et qu’ éventuellement une prévention permettrait éventuellement de le faire est-ce qu’il y a eu cette réflexion je dirais sur le

Un peu sur le sens de comment on peut aider au-delà de la santé publique éventuellement les personnes elles-même est-ce que des structurations statistiques accepté bien entendu par l’acnil et cetera permettrait dans ce caslà de répondre à une telle demande est-ce que est-ce que ça a été une de vos une

De votre questions oui jeux enfin je veux dire c’est une question même qui se pose au quotidien puisqu’on a une cellule de bioéthique c’est que de même qu’ y a une cellule informatique une cellule de biologiste une cellule de médecin une cellule de nutritionniste on a une cellule de bioéthique parce que ce

Sont des questions qui sont extrêmement clé dans quand on part dans un projet comme ça qui est de cette taille là qui est un projet citoyen qui est un projet de science participative par que c’est terme le terme enfin qu’on utilise dans ces cas-là c’est vrai qu’on a cet équilibre ces questionnements alors

C’est c’est une très bonne question parce que pour l’instant on a décidé on pourrait avoir des outils tout à fait valables qui respectent l’anonymat de retour d’information direct par exemple le profil du microbiote vers le volontaire c’est ça ma question mais et c’est d’ailleurs dans les questions qu’on nous pose parce

Qu’on peut interagir avec les volontaires par des systèmes me de messagerie sécurisé lié au site et et donc on a cette question qui est très régulière et qui est tout à fait légitime on a fait le choix pour l’instant de ne pas renvoyer le le résultat parce qu’on saurait pas

Aujourd’hui dire ce qu’il faut faire avec le résultat et donc on veut pas se substituer à une médecine prédictive qui n’existe pas encore en preuve même si elle est en devenir il est possible que quand on aura des éléments soit par d’autres équipes soit par nous-mêmes plus solides cette politique de

Restriction de renvoy de de profil puisse être changé mais on trouvait que c’était pas éthique d’envoyer de l’info pour l’info dont on savait pas quoi faire sauf troubler la personne par contre il y a un retour collectif sous forme de de newsletter en fait pour informer systématiquement et

Régulièrement je sais pas est-ce que vous pouvez passer mon écran voilà donc là j’ai mis le j’ai mis le site auquel vous pouvez tous accep accéder et on a oui j’ai oublié faire un don financier pour les gens qui veulent aider euh il y a la possibilité de faire un

Don finan voilà voilà on sait jamais les petites les petites les petites les petits ruisseaux dans les grandes rivières et cetera voilà mais si on veut participer au projet c’est une chose mais on peut aussi en savoir plus et donc on est dans des choses éducatives sur le microbiote avec

Des des des possibilités de d’éducation je vais dire qui renvoie à des à des à des choses voilà par exemple là aujourd’hui euh 24170 personnes se sont inscrites pour participer au moment où on se parle puisque c’est en permanence ça tourne donc les 14000 ont déjà fini le parcours

On va dire et d’autres ont dû arrêter en route et d’autres peut-être reprendront plus tard et ainsi de suite donc voilà donc on est sur cette effectivement démarche euh qu’on veut alors après c’est toujours compliqué le plus éthique possible parce que citoyenne mais c’est comment dire votre je trouve d’ailleurs que votre

Démarche est excellente parce que si on pr prend ten 3nb tel qui était fait justement sur les T génétiques qui était en fait une boîte maintenant rachetée par Google et cetera et ce trouve aux États-Unis et là les différents programmes les différ en résultat ét envoyé directement euh sans

Que pour autant une exp une explication soit tout à fait même quelquefois rationnel ça a été énormément critiqué et surtout sans que comme je le disais au début le fait de cliquer induisait tous les travaux de recherche derrière il suffisait simplement de cliquer de manière à voir son profil génétique mais

Sans pour autant savoir en définitive ce que les choses AV et visiblement là il y a une transparence dans dans votre circuit qui est tout à fait euh la 2è le 2è élément qu’on peut dire dans 23 and Me qui a été un de nos modèles avec

Corto Corto a fait sa thèse sa thèse d’université là-dessus justement et euh comment dire euh le le fait qu’il y ait un traducteur qu’il y ait un médecin pour justement traduire euh ce que l’on peut faire par rapport aux éléments de résultat qui était obtenu n’était pas obligatoire bien sûr aux États-Unis ça

Pouvait directement donc dans un service commercial donc visiblement là comme j’ai vu de la manre vous fonctionnez c’est particulièrementou euh les garanties éthiques sont particulièrement préservé oui oui on on sait enfin parce que je sais pas comment vous on peut exprimer ça mais par puisque c’est une demande des gens on

Pourrait se dire bah voilà nous on cherche à avoir le plus de gens possible donc il est normal de de dire voilà venez chez nous vous aurez votre profil de de de microbiote et un porteclé en plus et le porte vous pouvez pas l’envoyer voilà mais c’est pas la démarche la

Démarche est vraiment une démarche participative voilà c’est venez construire avec nous c’est avant tout une contribution à la science effectivement mais cependant on se pose vraiment ces questions là avec nos collègues bioéthticiens et ce qu’on envisage de faire c’est de donner la possibilité à travers une application qui sera développée spécifiquement pour

Le projet à à nos volontaires de sélectionner des catégories de population et donc par exemple de pouvoir illustrer à quoi ressemble le microbas des individus de plus de 50 ans ou de 50 à 55 ans qui ne fument pas qui ont tel indice de masse corporelle par

Exemple par rapport à l’ensemble de la population et donc ce serait un moyen de pouvoir un petit peu s’y retrouver dans son individualité par rapport à l’ensemble de la population étudiée quoi mais c’est plus pour répondre à cette curiosité en fait est assez naturelle hein qu’on qu’on voit tous les jours

C’est la coanalyse on vaut dire c’est en fait oui c’est c’est une espèce d’outil ludique qu’on aimerait pour que les gens puissent euh coanalyser mais pas pour l’instant alors maintenant si demain on on on on a un collègue qui dit voilà si le microbiote il est comme c comme ça et

On sait à 100 % que vous avez je sais pas quoi un truc c’est évident qu’on changera notre politique à nouveau mais en prenant les les les les les les les enfin en retournant vers nos volontaires en les réinformant et ainsi de suite pour l’instant on a vraiment réfléchi à

Ça énormément au début et on a fait ce choix stratégique hein parce que les qui était plutôt négatif en terme de de de marketing quoi pour rester justement dans les clous de pas aller à la facilité voilà en tout cas moi je suis très heureux de vous avoir invité tous

Les deux déjà parce que vous n’avez pas peur dès le départ de de parler d’intégrité scientifique en vous présentant comme tel n’est-ce pas Joël et ça montre bien comme quoi désormais dès lors qu’on est dans une frange à la fois publique privée où il peut y avoir des intérêts qui peuvent être différents

Mais il faut que la transparence soit tout à fait développée et rien que ça à mon avis plaît totalement pour votre démarche qui m’a paraît importante à bien souligner pascal tu as une parole une question oui merci ben bravo pour vos exposés c’est évidemment très intéressant enfin moi en tout cas

Évidemment ça m’intéresse beaucoup non mais j’ai j’ai une question qui rebondit complètement sur ce qui vient d’être d’être dit et d’être questionné Joë tout à l’heure tu nous as dit j’étais pas du tout au courant de ça que on envisage alors tu vas nous dire peut-être peut-être ou pas dans quel temporalité

Que des laboratoires de biologie euh médical quoi fassent des analyses du microbiat alors pourquoi je pose la question alors évidemment c’est en rapport avec ce qu’on Robert nous a dit euh euh sur les des données individuelles ou enfin des gens pourraient demander en effet c’est rapport aussi avec ce que les patients

Viennent nous demander alors ils vont faire les analyses en Allemagne en Belgique ou je sais pas où et c’est également en rapport avec c’est ce que moi je leur réponds alors parfois je fais intervenir Harry Sool qui est bon que vous connaissez tous et qui travaille énormément là-dessus euh

Sur je crois que bon il y a eu une mise en garde de la sfng et puis il y a eu un relais dans les grands médias je pense que c’est le monde je crois enfin ou libération leur journal de grand grand intérêt je dirais euh justement comment on envisage ça

Est-ce que c’est les les les laboratoires sont preneurs parce que il y a le problème de la validité enfin de l’inférence personnelle et donc moi je bon voilà je m’interroge là-dessus parce que les patients interroge donc les les praticiens les scientifiques vont s’interroger aussi oui oui et le les patients s’interrogent et l’offre

Actuelle elle est elle fait que les patients viennent vous voir vous médecin avec un beau rapport de 40 pages avec plein de belles image en vous disant docteur je sais que c’est ça qui qui est mon problème et qu’est-ce qu’il faut que je fasse et donc quelque part il faut

Vraiment qu’on ne s’inscrivent pas dans cette démarche là je pense que cette démarche là c’est une démarche qui doit répondre à la curiosité légitime et naturelle un peu comme 23 au début mais rien de plus et jamais au besoins médical et donc il nous a semblé que la

Voix normale pour répondre à une demande de médical ce soit que bah l’analyse puisse être prescrite et qu’elle puisse passer par un laboratoire de biologie aujourd’hui les laboratoirees de biologie notamment avec covid on fait beaucoup de de démarche d’équipement pour le séquençage et donc ils sont à

Peu près tous équipés pour faire le séquençage massif dont on a besoin pour faire une photographie du microbiote au sens moléculaire du terme donc les outils sont là les standards sont là j’ai insisté beaucoup làd dessus mais c’est vraiment clé c’est-à-dire que le prélèvement de la selle cette première

Étape en fait elle conditionne la qualité des résultats à la sortie donc c’est vraiment important de s’inscrire dans les standards c’est pas compliqué aujourd’hui d’apporter les recommandations à des laboratoires de biologie pour que ce soit fait comme il faut et par contre et je l’ai souligné l’analyse de la donnée est quelque chose

De compliqué aujourd’hui il y a que des services spécialisés en fait des équipes spécialisées qui sont capables de faire ça et c’est quelques sur la planète donc c’est vraiment quelque chose de pas simple et donc là il faut qu’il y ait associé au laboratoire de biologie le Data

Scientiste qui va pouvoir apporter le le les les moyens de triturer la donnée pour la faire parler et puis après pour la faire parler si effectivement vous voyez où tu vois des patients arriver avec des rapports il y a 40 pages il y a plein plein d’images et qui servent à

Rien là-dedans il y a une donnée ou quelques données qui qui sont comme la ligne du cholestérol dans le rapport d’analyse biologique et qui peuvent être pertinentes dans certains contextes en fait et d’un contexte à l’autre en clinique ce sera pas le même la même

Donnée donc on est convaincu de ça et on est convaincu qu’il y a beaucoup de chemins à faire et je suis pas du tout en disant ça en désaccord avec la tribune dans Le Monde ou la vie de la SNFGE sur ce qu’apporte les les services

À la personne en direct quoi le direct consommateur finalement et consommateur est un bon terme à mon avis dans ce contexte par contre je je pense que il faut encore parcourir un chemin non négligeable pour pouvoir en faire une donnée utile est-ce que c’est bien expliqué dans la lotif d’information

Ou sur le site lque ah oui oui enfin je par parce que c’est d’une clarté là ce qui est en train de je vais pas remettre le le le site mais on peut on peut le lire ensemble non mais je vous demande on vous cro ici non non on peut le lire

Ensemble on a fait très attention à ça alors malgré ça parce que ça fixe bien en définitive votre recherche et surtout les attendes que chacun peut faire de cette recherche mais c’est marqué noir sur blanc mais il l’empêche que il y a certaines personnes qui sont pas des idiotes du tout qui ont

Lu et et et voilà qui mais je sais que j’ai lu mais est-ce qu’on pourrait pas quand même avoir mes résultats personnels là j’étais ce matin céit une infirmière qui était charmante qui m’explique d’ailleurs qui avait une très bonne question je dois faire un mémoire avec mes collègues de la promo c’est une

École d’infirmière en province euh sur le l’effet du travail de nuit sur le microbiote je trouvais ça génial comme idée on est 20 on doit faire le mémoire est-ce que si on participe au Franch gut euh pourriez nous donner nos résultats et et donc j’ai j’ai pas répondu encore

Parce que faut prépare non parce que c’est tellement mignon que je tu es tenté tu es tenté voilà voilà c’est tellement mignon qu’ faut que je fasse une belle réponse mais mais mais non parce que il faudrait un une autorisation réglementaire supplémentaire il faudrait un protocole

Spécial et la pauvre elle aura fini ses études le temps qu’on fasse tout ça quoi mais oui c’est voilà on est tenté mais non en complément moi je suis complètement d’accord avec toi évidemment la SFN je crois c’est 2022 ils ont fait leur truc mais ce qui était

Vrai en 2022 sont pas ou 23 bon il ne sera peut-être pas vrai en 2025 on verra en je sais pasenir ouais ça va venir non le le la question complémentaire c’est est-ce que il y a un projet de nomenclaturage parce qu’en gros pour la biologie médicale à moins que les gens

Soient d’accord de non non€ non non non ça je suis à peu près au courant euh il y a il y a il y a pas assez d’évidence base médecine aujourd’hui pour rentrer dans des démarches réglementaires et encore moins de remboursement et quand je quand je

Dis c’est pas le rapport de 40 pages c’est un paramètre qui va être une ligne finalement et qui va positionner le patient par rapport au reste de la population moi je peux l’illustrer par rapport à ce que je montre sur la richesse du microbut intestinal quand on

Est du côté possible sibiose du côté microbiote atrophié on sait que pour l’instant pour dans les données qu’on a pu générer le risque est accru de développer ou de moins bien répondre au traitement et cetera ben quand on aura effectivement le pipeline complet à disposition c’està-dire qu’il faut qu’on

Puisse passer par le laboratoire de biologie passer par la prescription passer par l’analyse pour pouvoir effectivement construire la réponse à cette question est-ce qu’on a une évidence de bénéfice clinique ou pas et donc quand on pourra le faire effectivement je pense que des laboratoires de biologie seront intéressés à contribuer à l’aventure

Parce que c’est une ouverture d’un champ un peu nouveau en fait he je pense qu’on peut dire que c’est certain que ça va arriver oui par contre le timing est-ce que ça va il y aura une accélération et c’est tu vois dans un an on va commencer à

Faire les dossiers ou est-ce que dans 5 ans sera toujours en discuter ça je sais pas mais par contre ça je sais c’est je vois pas en il y a des pays où qui sont moins moins rationnels que nous ou plus business je sais pas comment il faut

Appeler ça mais les médecins du microbiote existent déjà c’est pas un rêve he c’est que il y a des gens installés comme spécialiste du microbiote dans certains pays que c’est c’est une il y aura des microbioteurs comme il y a des cardiologues et des gastro-entéropodes voilà allez dal là ouais oui ça marche

Merci Joë merci Robert pour vos présentations j’ai appris plein de choses moi j’avais une question [Musique] sur la végétalisation de l’alimentation et en même temps les risques d’entéropathie c’estàd qu’on a quand même dans en Afrique une des populations qui sont plutôt qui ont une alimentation très végétale principalement à base de de

Céréales mais qui souffre aussi de malnutrition protéique qui souffr d’antéropathie alors est-ce que c’est la malnutrition protéique qui va provoquer par des carences en acid aminé je pense notamment à la tréonine et au mucus par exemple qui va provoquer ces situations est-ce que c’est au contraire les antéropathies qui sont responsables

Est-ce que c’est des situation qui peut favoriser aussi finalement un profil du microbiote qui va favoriser l’installation de certains pathogènes enfin qu’est-ce qu’on a comme donné là-dessus parce que j’ai l’impression ne pas avoir vu de corps euh en Afrique on a on a enfin il y a eu

Un travail qui a été réalisé par l’institut Pasteur sur un programme qui s’appelait afribiota mais qui était vraiment basé sur ou centré sur le euh les périodes précoces de la vie et euh le risque de stunting justement euh donc un programme et c’était le seul à ma

Connaissance qui a intégré un petit peu la donnée microbiote dans le dans le travail euh en fait je je je pense que il y a la nutrition et la sous-nutrition ou la malnutrition et ses conséquences et ce que j’évoquais qui est plutôt en pays où on a tellement de plor que on

Mange trop et pas bien et à ce moment-là la possibilité de jouer un petit peu sur l’apport protéique pour être à la fois en meilleure santé et moins impactant sur la planète en fait c’est c’est vraiment mais c’estes deux terrains complètement différents à mon sens et

Euh et là où ça se rejoint c’est jusqu’où on peut effectivement moduler l’alimentation euh sans atteindre un niveau où effectivement il faut supplémenter ou il faut éviter des carences quoi pour ce qui nous concerne nous et par contre on a encore énormément de de progrès à faire pour gérer la malnutrition et la

Sous-nutrition dans dans les les pays concernés donc je pense que c’est vraiment deux deux volets différents et je c’est comme comme je suis pas nutritionniste en réalité je suis pas complètement à l’aise pour aller beaucoup beaucoup plus loin dans ma réponse mais je j’ai tendance à être

Convaincu étant donné que on a on a des des situations enfin on a des des pratiques alimentaires qui mettent vraiment une part de végétal beaucoup plus importante que ce qu’on fait en moyenne on va dire en France et qui pourtant ne s’accompagne pas de de carence donc je pense qu’on doit pouvoir

Gérer cette partie là de notre côté sans sans trop de mal en fait quoi avec l’A des nutritionnistes oui merci merci beaucoup pour votre présentation qui est très très intéressante euh comment devient du coup un médecin du microbiote donc les formations qui sont disponibles aujourd’hui en universitaire sur la

Région parisienne je crois que il y en a qu’une qui est à Paris Sorbonne euh et je je et elle est assez fondamentale elle est pas très pratique euh et aujourd’hui le champ de cette micronutrition et de du microbiote est occupé de plus en plus par des non soignants euh donc pas

Forcément des nutritionnistes pas forcément des médecins pas forcément et donc par des beaucoup de naturopathes qui ont une formation il y a des très bons naturopathes mais il n’ont pas forcément une formation scientifique et une formation médicale donc comment vous vous voyez voilà l’avenir de cette formation

On est dans le champ du soin on est dans le champ du diagnostic et comment on va se former les soignants quel que soit le soignant qui soit nutritionniste qui soit médecin ou généraliste ou spécialiste Pascal peut répondre question difficile deuxè question enfin je peux répondre à votre

Question sous l’angre de la médecine pourquoi parce que parmi moi je suis gastroentérologue comme monsieur benamousig je suis aussi professeur nutrition n pas de gastroentérologie mais n’est parfait mais c’est proche et et et en gros dans le cadre de de la nutrition on a un collège travaille avec

Les CNU et on a on valide des formations pour la formation initiale et la formation continue des docteurs en médecine attention hein je parle pas des pharmaciens je parle pas des agronome je parle pas des autres spécialités moi je suis médecin et c’est pour les et donc

La la seule formation que nous avons validée c’est en effet celle de Madame Clément euh également professeur nutrition à sbon université donc c’est la seule qui existe hein c’est la seule que nous avons validé euh et dans le cadre de les formations continues alors là c’est des endocrinologues parce que

La nutrition c’est mariée avec l’endocrinologie s’appelle le DN bon endocrinologie diabétologie nutrition c’est également la seule formation que nous avons valider au niveau médical voilà mé je pour les autres disciplines et soignant je ne sais pas et en effet tout toutes les formations naturopathes micronutrition et cetera pour nous en

Tant qu’universitaire et médecin en nutrition ne sont pas enfin ne sont pas valables mais après chacun fait ce qu’il veut hein mais VO ce que je peux vous dire pour les médecins alors c’est c’est vrai pour les médecins endocrinaux diabétau mais aussi gastro médecine générale toute spécialité hein bien sûr d’accord

Voilà bonjour Merci pour votre présentation alors moi je vais redescendre au niveau de mon grand-père qui était paysan et d’une famille qui est plutôt à l’abri de beaucoup de pathologies et qui n’a jamais eu aucune pathologie chronique et qui a vieilli très très très vieille on on a envie de penser comme ça

Que notre microbiote familial est est plutôt performant et nous protège de tout ça et euh de se dire que si jamais on nous expose soit une antibiothérapie destructrice soit une chimiothérapie soit quoi que ce soit on aurait envie d’avoir notre propre microbiote mis de côté pour pouvoir se l’autoransplanter euh est-ce que c’est

Envisageable ben alors où on en est sur l’aspect transfert de Microbot fécal j’ai évoqué l’exemple de la société mat Pharma qui est basée à Lyon qui conditionne des contenus intestinaux humains qui les préserve soit congelé avec une totale préservation de l’intégrité du microbiot intestinal de départ soit lyophilisé la stabilité de la

Lophilisation donc dans des capsules qui peuvent être utilisées en prise orale qui sont testé aujourd’hui dans le mélanome en fait en association l’immunothérapie iseorale elle est de je crois que la validation actuelle est 2 ans et demi ou 3 ans quelque chose comme ça lophilisé on peut espérer que ça

Tienne beaucoup plus longtemps en fait donc du coup sur ce cet aspect purement technique pourquoi pas je pense qu’il doit y avoir déjà des sociétés aux États-Unis qui surf sur cette idée là parce que elle est elle est assez naturelle à à imaginer évidemment vraiment ce que je vois dans

Le domaine en fait c’est les sociétés qui se développent et qui proposent des solutions de thérapie par l’écosystème intestinal pour l’instant c’est les sociétés qui s’inscrivent dans une indication clinique particulière la première ça a été l’infection à clostromeicilé parce que ça tue encore beaucoup de gens et que on a pu montrer

En 2013 dans le New England que le transfert de microbat fécal et s’il marche pas la première fois on en fait une deuxième guérit 90 % des gens mais guérit de façon définitive 90 % les patients il y a pas beaucoup de médicaments qui font ça contre contre

Eux 30 % pour l’antibiotique de dernier recours et donc ça ça a été reconnu par les agences et ça a conduit à deux autorisations de mise sur le marché l’année dernière en 2023 donc il y a déjà des sociétés qui produisent des médicaments qui sont reconnus pour cette application là toutes les autres

Applications aujourd’hui c’est au stade de la recherche donc on voit bien qu’il y a encore beaucoup de chemins à parcourir avant que l’on soit complètement sûr de ça marche ou ça marche pas en fait dans les différents domaines en France on a un essai de phase 3 quand même donc c’est le

Dernière étape avant le la demande autorisation de mise sur le marché pour prévenir la maladie du greffon contre l’autre dans le traitement de du cancer du sang après une une greffe de moileosseuse mais mat Pharma je l’ai indiqué a fait son premier essai en utologue justement c’estàdire que c’était des patients qui étaient

Prélevés avant qu’on les martyrise avec un traitement du cancer quoi et ensuite réadministrer quand on a monté cet essai on pensait queon est on allait pouvoir transférer tout le monde quoi c’était de l’utologue le règlementaire a dit mais non non mais vous passez par le crible classique et le crible classique c’est

Il y a pas donc il y a 40 ou 50 pathogènes différents bactéries virus proties qui sont analysés en fait et qui exclu complètement le don pour des donneurs sains pour glastrome difficilé et puis il y a aussi des questionnaires qui vérifie que vous avez aucune historique de maladie chronique dans

Vous-même et dans vos vos antécédent ou dans vos parents et donc bah après un crible comme ça en fait les sociétés américaines qui banquent des selles elles disent oua il y a 3 % de personnes éligibles et c’est ce qu’on voit à peu près en France aussi sur des donneurs

Sains donc quand madfarma a fait son essai pour 100 patients on aurait souhaité en fait entrer dans l’essai bah il y avait 30 qui étaient éligiblebl c’est-à-dire que même sur l’autologue le règlement entaire interdit que vous transfériez un contenu intestinal qui va contenir des facteurs de résistance au antibiotiques par exemple parce que

Après avoir complètement perturbé le Microbot intestinal et mis en terérococus en dominance tout seul si vous rajoutez un résistant aux antibiotiqu vous pouvez ne jamais pouvoir sauver la personne en fait quoi il y a eu de morts aux États-Unis en fait dans des contextes comme ça après que l’agence réglementaire a dit

Résistance au antibiotiques on interdit maintenant ils sont allés chercher des échantillons qui étaient dans les congélateurs et ça a tué des gens donc du coup voilà on est loin loin loin de pouvoir concevoir le le biobanking de celle humaine pour la transplantation autologue aujourd’hui donc tu conseilles

Pas de réserver un tiroir de son congélateur pas encore [Rires] ou mais mais c’est une bonne question en fait et et et je pense que ça c’est quelque chose qui pourrait arriver à terme j’ai contribué à la à la création de la société matfarma en question et dans les

Premières années alors qu’on est dans des phases où justement on fait du brainstorming et on peut se laisser aller on imaginait pouvoir prélever B des selles de médecin en fait parce qu’ils sont exposés durablement et beaucoup et donc ce serait une solution on on imaginait nos militaires on

Imaginait nos astronautes aussi qui sont exposés à la microgravité et à des choses qui changent leur Microbot très rapidement en réalité et on envisage d’envoyer des gens longue distance dans l’espace bah voilà ce serait bien d’avoir leur microbiot dans leur poche en fait et donc on n’a pas complètement

Oublier ces idées-là mais pour l’instant il faut construire de la science pour être tranquille en fait quoi et on n’est pas encore tranquille du tout euh bonjour jeunevè Margnac je suis représentante d’une autre partie du oneels en tant que vétérinaire euh j’avais une question à à vous deux en fait

Euh donc euh monsieur doré j’aurais voulu savoir si la présence d’un animal domestique ou le travail avec des animaux domestiques affectait le Biotop et pour monsieur benabousi je voulais savoir si parmi les quelques questions que vous posiez il y avait cette question alors la la réponse aujourd’hui

Maintenant est non mais mais mais mais mais ça a été ça ça a été mis sur la table et ça a été un drame quand on est arrivé parce qu’en fait il fallait qu’on tienne dans les 10 minutes et c’est ça va certainement revenir on on a même je

Crois déjà commencé à faire nos premiers tests avec les animaux domestiques et des investigateurs et oui oui c’est une très très bonne question et on est sur cette voie làà aussi oui et est-ce que ça affecte le microbiote ben en réalité oui c’est-à-dire que les outils qu’on utilise aujourd’hui sont tellement haute

Résolution que on peut effectivement identifier le transfert de microbiotes de plein de façons différentes et donc le le fait qu’on va retrouver des microbes de l’environnement on peut imaginer une naissance par césarienne il y a beaucoup de microbes environnementaux qui vont se retrouver en dominance dans le microbote intestinal pendant les premiers moments

De la vie et de la même façon on a pu montrer que un baiser appuyé est un moyen de transférer des microbes pas mal dans dans le dans le microbiote oral et que le fait d’avoir un animal domestique conduit à la possibilité d’identifier dans le Microbot intestinal quelques espèces quelques souches microbiennes en

Fait qui viennent de de l’animal donc on a pu documenter ça ça veut pas dire qu’on va reconstruire complètement le le microbiote on en est loin c’est juste voilà une observation qui est peut-être analogue à celle de ce qu’on fait quand on donne du yaourt deux fois par jour à

Des volontaires et on arrive effectivement à voir dans leur Microbot intestinal dominant certaines bactéries lactiques qui sont utilisé pour la technologie quoi parce qu’en fait je suis je suis dermatologue et du coup c’est une observation qu’on a fait il y a très longemps c’est-à-dire qu’il y a

Pas de staphoréus chez le chien mais par contre si le propriétaire a des maladies avec du staphoréus ou est porteur de staphorus à ce moment-là le chien peut développer une maladie de peau avec des staph Orus qui est une maladie de peau qui va être transitoire chez le chien

Enfin peut-être nécessiter un traitement mais en tout cas le chien va pas rester porteur de staphoreus sur la peau mais si un chien a un staphoréus ça c’est que ça vient de son propriétire HM qui pour être intéressant c’est queob du chien protège le propri et ben voilà parce que

Franchement toutes les toutes les théories sur le fait que il y a une protection avec liée à la présence d’un animal de compagnie avec moins de maladies disimmunitaire et tout ça je me dis euh tout à coup là je suppose que j’ai pas inventé l’eau tiède et que il y a

Beaucoup de gens qui ont pensé avant moi mais il y Ava vraiment pas de travaux mais je me dis que là il y a peut-être quelque chose il pensit c’est une chose mais mais avoir avoir créé du savoir il y a une différence ou oui oui il y a pas

Et on est vraiment à la racine du savoir et si ça enfin je serais ravi d’échanger avec vous parce que en fait je vous ai raconté les naïf de l’école de de mais je respecte beaucoup leur idée je et votre idée elle est déjà sur la table

Tout c’est comment on peut la construire de la façon la plus fine et c’est vrai d’avoir des vêteaux avec nous ça serait ça serait top ça risque it devenir un BIA autrement un facteur confondant bien sûr qui veulent poser des questions est-ce que vous Pez des questions ah très

Bien bonjour merci pour la présentation j’avais une petite question sur la dépression chez les rats vous avz aborder le sujet tout à l’heure et comparer le traitement par tricyclique avec les compléments alimentaires et ma question c’était si l’effet qu’on avait observé euh continuait à l’arrêt du traitement si a dépression continua

D’être guérie ou si on avait un retour un statut dépressif alors en fait on a des animaux qui sont induits par un stress imprédictible de 4 semaines donc on va les les embêter pendant 4 semaines et on les installe dans une situation où ils sont durablement altérés au point du

Comportement c’estàd qu’on va pouvoir mesurer euh l’anxiété ou la dépression par des des mesures normalisées et c’est durable et ils sont durablement altérés il y a un peu d’inflammation et il y a un microbiote qui est également altéré et donc euh ce que l’on mesure dans ces

Essais qui sont en fait les essais qui sont utilisés pour valider les les antidépresseurs sur la phase préclinique euh c’est la correction définitive du comportement en fait et donc euh nous on a utilisé le le modèle tel qu’il est utilisé classiquement donc c’est effectivement 3 semaines de traitement et puis on sacrifie les

Animaux mais le le modèle lui-même montre une résolution durable de du comportement animal et alors je l’ai pas dit mais le l’essai préclinique a permis de déposer un protocole qui s’appelle promou qui a été commencé avec trois hôpitaux et qui est sur les patients qui échappe au premier traitement antidépresseur et qui

Passe sous la V lafxine comme antidépresseur et on a une randomisation et on a des patients qui sont avec placebo versus le mix de d’actifs que j’ai présenté en fait pour voir si ça améliore en adonne l’efficacité du traitement j’avais une deuxième question euh concernant l’autisme vous avez

Abordé le sujet aussi je sais que la physiologie la physiopathologie de l’autisme n pas encore été franchement définie euh est-ce que vous pouvez un petit peu élaborer sur ce que vous avez vu vousou donc je je je je l’ai utilisé j’en ai parlé dans quand je présente à

La fois notre notre parcours en fait notre parcours habituel c’est on commence par comparer les patients et les sujets sains dans l’autisme la première publication ça doit dater de 1976 quelque chose comme ça donc les techn étaient pas tout à fait ce qu’elles sont aujourd’hui mais il y en a

Eu beaucoup en fait et moi j’ai encore un projet en cours actuellement où on compare les microbiotes de d’autiste high performance qu on dit enfin les ex asperger en fait avec des des sujets sains et on arrive à identifier des des signatures assez nettes de l’autisme avec un facteur confondant majeur qui

Est la santé ou les symptômes intestinaux en fait il y a aussi beaucoup plus de symptômes intestinaux dans l’autisme qu’en population générale et puis la nécessité de prendre en compte tous les facteurs confondants dont l’alimentation en fait euh et euh la deuxième étape dont j’ai parlé c’est

Le transfert vers l’animal et il y a des travaux assez euh assez intéressants qui ont montré que si on transfère le microbut dans enfant autiste versus non autiste sur des animaux alors des molet souris qu’on met à reproduire et on analyse les paramètres seulement sur la descendance la première génération bien

Là on a quand on transfère le microbote d’un enfant autiste un Microbot altéré on a un comportement altéré on a est durable on a de l’inflammation et on a même des métabolites donc sur le métabolome l’ensemble des métabolites produits par les microbes des métabolites qui disparaissent qui si on

Les utilise pour corriger l’autisme dans un modèle de souris autiste marche en fait quoi donc corrige donc là ils disparaissent quand on transfère le microbud d’un enfant autiste et on a de l’expression de gène au niveau du cerveau qui est également altéré et notamment des gènes qui sont connus pour

Être des gènes de prédisposition en troup du neurodéveloppement donc cette information là elle est elle est assez bluffante et puis ça va plus loin euh quelques années après on a une équipe américaine qui dans un essai euh ouvert donc donc là on n’est pas sur du placebo

Du contrôlé un essai ouvert 18 enfants autistes donc 80 autistes sévères sont soumis à un transfert de Microbot fécal assez intensif c’estàd qu’il y a un premier bolus par voix basse et puis ensuite il y a des capsules quotidienne pendant un mois et l’objectif assez modeste de l’étude est de résoudre les

Symptômes intestinaux qui sont hautement prévalents chez ces enfants et il publie cette année-là que effectivement en 2 semaines il résolvent les les problèmes intestinaux et puis à partir d’un mois il commence à avoir des effets comportementaux sur les enfant autiste avec notamment l’aptitude à se concentrer plus longtemps et à réaliser

Des petits exercices de très très simples en fait quoi mais significatif c’est leur leur métrique et il republient 2 ans après notamment parce que les parents sont revenus les voir euh et ils nous disent on a commencé avec 80 % d’auti sévères on a plus que

20 % d’auties sévères 2 ans après et on a 40 % des enfants qui sont sortis du spectre tel qu’on le mesure donc ça c’est assez bluffant et donc l’équipe américaine en question est en train de refaire un essai qui a démarré au milieu de covid donc est un peu en retard mais

Sur une population un peu plus large euh parce que c’est des groupes d’âg là maintenant qui incluent des adultes en fait euh et et plus importante en nombre donc on voilà on attend ces résultats là ouis alors si si euh pour ce que je voulais border donc moi je suis le

Docteur Barisien je suis médecin de de MPR à Foche je me suis beaucoup occupé de covid long et là on va pas développer le covid long mais il y a pareil pas beaucoup de travaux de recherche sur l’influence des infections virales pas forcément covid viral sur le microbiote et les influences sur les

Symptômes prolongés mais ce sur quoi je voulais revenir c’est vos deux remarques précédentes hein c’est les métabolites émis par le microbiote et leur implication sur les sécrétions neuro-endocriniennes et en particulier le parallèle avec les antidépresseurs les IRSN ont une action on a montré que leur action étit agissé sur les

Neurosécrétions cérébrales et on a des effets équivalent en modifiant l’alimentation et ou le microbiote et donc on est en train aussi de se rendre compte qu’il y a une partie des symptômes dépressifs qui sont soit d’une maladie maladie mais aussi peut-être juste d’une disbiose h et qu’on pourrait soigner de manière moins

Coûteuse avec moins d’effets secondaires mais il faut qu’on puisse avancer aussi dans le diagnostic oui qu’on propose aux patients en leur disant bah voilà vous avez peut-être des syndromes neurologiques qui sont associés à une dysbiose et aujourd’hui ça on en pratique clinique on on a du mal à le

Faire ou ah oui et est-ce que on va avancer plutôt sur le fcalogramme ou est est-ce que l’avenir de ça c’est plutôt voilà le le le walg shotgun qu’est-ce que vous en pensez euh comment quelle est la distinction pour vous entre le fcalogram et le le wolgot shotgun B le

Fcalogramme c’est on prend une des selles et sur les espèces qui qui sont survivantes à l’aérobie on fait une rép voilà par culture on fait une répartition et on voit la famille des des bifidus la famille des anobérii ou oui d’accord d’accord bah le l’avenir nous dira comme comme Robert l’indiquéit

Tout à l’heure je je je suis biaisé forcément mais je pense que étant donné la diminution des coûts qu’on voit aujourd’hui ça me semblerait tellement plus logique de faire un un shotgun complet c’est-à-dire une caractérisation exhaustive même si on ne va retenir parce qu’on l’aura documenté en terme de

Bénéfice clinique que un ou deux paramètres clés ça peut être une espèce bactérienne ou un genre bactérien particulier en fait ou pourquoi pas faire du métabolô complet associé et prendre la combinatoire de quelques métabolite et quelques genres bactériens par exemple mais je je je pense que la logique serait d’aller sur ce terrainlà

Parce que ce terrainlà aujourd’hui à l’air de la data permet de d’engranger énormément d’informations et de la mouliner quand on a suffisamment de matière en fait quoi donc donc ça me semblerait plus logique d’aller sur ce ce ce chemin mais si vous voulez bien nous en sommes

À 19h nous devons peut-être nous quitter et peut-être nous donner rendez-vous la prochaine fois c’est-à-dire le 26 mars pour un thème qui sera le trou le trouble des conduites alimentaires et je tiens à remercier particulièrement Joë et Robert de nous avoir communiquer à la fois leurs résultats mais surtout leurs pratiques

Et leurs postulation par rapport à leur recherche et je pense que c’est particulièrement important merci beaucoup donc au 26 [Applaudissements] mars